目的:运用网络药理学方法研究加减半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)获取加减半夏泻心汤化合物及靶标,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB) ≥30%和类药性(drug likeness,DL) ≥0.18及半衰期(half-life,HL)≥4 h为阈值进行化合物筛选,将靶标输入Uniprot获取靶标对应的基因Symbol;从人类基因数据库(Gene Card:The Human Gene Da-tabase)获取幽门螺杆菌相关性胃炎疾病基因,并筛选出与加减半夏泻心汤靶标基因的交集基因;运用Cytoscape 3.7.2软件绘制"疾病-中药-化合物-交集靶标(基因)"网络图、STRING构建蛋白互作网络、利用分子对接技术对关键靶点和化合物的相互作用进行验证.Profiler数据分析平台进行基因本体(gene ontology,GO)富集以及京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopaedia of gene and genomes,KEGG)通路富集分析.结果:通过设置OB和DL及HL值筛选得到加减半夏泻心汤化合物239种,涉及加减半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用预测靶点有189个.网络拓扑分析结果表明,Cytoscape 3.7.2拓扑分析得到肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、JUN、丝裂原活化蛋白激酶1(m
作者:刘令令;段飞;杜巧婷;崔晨辉
来源:中医学报 2022 年 37卷 3期