目的:基于2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(3CL protease,Mpro)的三维结构,采用分子对接技术和网络药理学方法探寻祛肺毒一号方治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)的物质基础和作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCM-SP)及文献检索搜集祛肺毒一号方组方中药的化学成分,并以类药性(drug likeness,DL)≥0.18及口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%为标准进行筛选,采用分子对接技术将筛选出的化合物与2019-nCoV 3CL Mpro对接,以结合能小于-9 kcal·mol-1为标准,筛选祛肺毒一号方的活性成分.运用SwissTargetPrediction数据库预测活性成分的作用靶点,并在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、美国国立生物技术信息中心(national center for biotech-nology information,NCBI)数据库及CTD数据库检索COVID-19相关靶点,采用venny 2.1软件得到活性成分作用靶点与COVID-19相关靶点的交集靶点.将交集靶点导入STRING11.0数据库,最终获得蛋白质相互作用网络图.采用DA-VID数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyo
作者:孙洁;蒋士卿
来源:中医学报 2022 年 37卷 5期