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目的:基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)及实验验证初步探究养肺方治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选养肺方组方中药的化学成分.利用中医药百科全书(The encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)预测养肺方活性成分相关靶点.运用GEO平台下载基因芯片GSE118370,采用GEO2R归一化数据并分析差异基因.采用WGCNA进行基因模块分析并筛选疾病靶点基因.利用Cytoscape 3.7.2 软件构建的"药物-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选有效药效成分.将WGCNA筛选出核心基因与药物靶点取交集得到治疗靶点,并构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2 中的CytoHubba筛选出核心治疗靶点.利用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.40 只雄性Wistar大鼠随机分为养肺方组(400 g·kg-1)和空白组,每组20 只,大鼠连续灌胃给药7 天,每天2 次,灌胃结

作者:庄垚雪;林事成;刘殿娜;高磊;孙静宜;魏佳;李泉旺

来源:中医学报 2023 年 38卷 9期

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作者:
庄垚雪;林事成;刘殿娜;高磊;孙静宜;魏佳;李泉旺
来源:
中医学报 2023 年 38卷 9期
标签:
非小细胞肺癌 养肺方 PI3K/AKT通路 细胞凋亡 网络药理学 加权基因共表达网络分析 non-small cell lung cancer nourishing the Lung PI3K/AKT pathway apoptosis network pharmacology weighted gene co-expression network analysis
目的:基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)及实验验证初步探究养肺方治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选养肺方组方中药的化学成分.利用中医药百科全书(The encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)预测养肺方活性成分相关靶点.运用GEO平台下载基因芯片GSE118370,采用GEO2R归一化数据并分析差异基因.采用WGCNA进行基因模块分析并筛选疾病靶点基因.利用Cytoscape 3.7.2 软件构建的"药物-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选有效药效成分.将WGCNA筛选出核心基因与药物靶点取交集得到治疗靶点,并构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2 中的CytoHubba筛选出核心治疗靶点.利用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.40 只雄性Wistar大鼠随机分为养肺方组(400 g·kg-1)和空白组,每组20 只,大鼠连续灌胃给药7 天,每天2 次,灌胃结