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目的:应用网络药理学和分子对接探究桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选桂枝茯苓丸组方中药有效成分及相应作用靶点.在DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD和OMIM五大数据库检索异位妊娠相关靶点,并与药物作用靶点进行映射,取交集得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点.应用Cytoscape_v3.9.1 软件构建"桂枝茯苓丸-异位妊娠"调控网络,并使用CytoNCA插件进行拓扑分析筛选关键化合物.将潜在靶点输入STRING在线平台获得蛋白互作(protein-pro-tein interaction,PPI)关系,通过Cytoscape_v3.9.1 构建PPI网络并进行拓扑分析筛选核心靶点.使用David数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock vina软件对关键化合物与核心靶点进行分子对接.结果:运用TCMSP数据库筛选得到桂枝茯苓丸有效成分85 个,相关靶点525 个.于DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD、OMIM五大数据库检索得到异位妊娠靶点3 055 个.桂枝茯苓丸有效成分作用靶点与异位妊娠总靶点

作者:刘颖;张天婵;张梦颖

来源:中医学报 2023 年 38卷 12期

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刘颖;张天婵;张梦颖
来源:
中医学报 2023 年 38卷 12期
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桂枝茯苓丸 异位妊娠 网络药理学 分子对接 作用机制 张仲景 Guizhi Fuling Pill ectopic pregnancy network pharmacology Molecular docking mechanism of action Zhang Zhongjing
目的:应用网络药理学和分子对接探究桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选桂枝茯苓丸组方中药有效成分及相应作用靶点.在DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD和OMIM五大数据库检索异位妊娠相关靶点,并与药物作用靶点进行映射,取交集得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点.应用Cytoscape_v3.9.1 软件构建"桂枝茯苓丸-异位妊娠"调控网络,并使用CytoNCA插件进行拓扑分析筛选关键化合物.将潜在靶点输入STRING在线平台获得蛋白互作(protein-pro-tein interaction,PPI)关系,通过Cytoscape_v3.9.1 构建PPI网络并进行拓扑分析筛选核心靶点.使用David数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock vina软件对关键化合物与核心靶点进行分子对接.结果:运用TCMSP数据库筛选得到桂枝茯苓丸有效成分85 个,相关靶点525 个.于DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD、OMIM五大数据库检索得到异位妊娠靶点3 055 个.桂枝茯苓丸有效成分作用靶点与异位妊娠总靶点