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目的:基于网络药理学与分子对接探讨扶正感康丸治疗新型冠状病毒感染的作用机制.方法:通过检索 TCMSP 及HERB数据库获取扶正感康丸6 味核心药物的有效成分及作用靶点;分别在Genecards数据库、国家生物技术信息中心数据库(national center for biotechnology information,NCBI)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库检测新型冠状病毒感染相关疾病靶点,并取其与活性成分的交集靶点.采用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,并采用Cytoscape软件对PPI网络进行分析筛选核心靶点.通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG信号通路富集分析.通过检索BioGPS及Genecards数据库获取关键通路涉及的靶点的组织分布及亚细胞定位数据.采用AutoDock Vina1.1.2 对关键有效成分和核心靶点进行分子对接.结果:扶正感康丸6 味核心药物共含活性成分85 个,相关靶点226 个.检索Genecards、NCBI及KEGG数据库获得新型冠状病毒感染疾病靶点3 510 个,与活性成分相关靶点取交集,得到 86 个交集靶点.槲皮素、山柰酚、豆甾醇等为核心成分.PPI网络分析得到白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumo

作者:张明利;符诚;潘晔;王欣

来源:中医学报 2023 年 38卷 12期

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作者:
张明利;符诚;潘晔;王欣
来源:
中医学报 2023 年 38卷 12期
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扶正感康丸 新型冠状病毒感染 网络药理学 分子对接 作用机制 Fuzheng Gankang Pill COVID-19 network pharmacology molecular docking mechanism of action
目的:基于网络药理学与分子对接探讨扶正感康丸治疗新型冠状病毒感染的作用机制.方法:通过检索 TCMSP 及HERB数据库获取扶正感康丸6 味核心药物的有效成分及作用靶点;分别在Genecards数据库、国家生物技术信息中心数据库(national center for biotechnology information,NCBI)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库检测新型冠状病毒感染相关疾病靶点,并取其与活性成分的交集靶点.采用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,并采用Cytoscape软件对PPI网络进行分析筛选核心靶点.通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG信号通路富集分析.通过检索BioGPS及Genecards数据库获取关键通路涉及的靶点的组织分布及亚细胞定位数据.采用AutoDock Vina1.1.2 对关键有效成分和核心靶点进行分子对接.结果:扶正感康丸6 味核心药物共含活性成分85 个,相关靶点226 个.检索Genecards、NCBI及KEGG数据库获得新型冠状病毒感染疾病靶点3 510 个,与活性成分相关靶点取交集,得到 86 个交集靶点.槲皮素、山柰酚、豆甾醇等为核心成分.PPI网络分析得到白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumo