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目的:失巢凋亡(anoikis)是一种特殊类型的细胞凋亡,主要发生在细胞与基质联系丧失(失去锚定)时,对维护体内环境稳定起着重要的作用.本研究旨在构建一个在三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中与失巢凋亡相关的基因集以及预后模型,同时可以用于预测患者有效治疗药物.方法:对TCGA-BRCA数据集中的TNBC患者进行单因素和多因素Cox分析,以得出失巢凋亡相关基因集(anoikis-related gene signature,ARGS).采用Gene Expression Omnibus(GEO)数据集进行独立验证.将ARGS与临床病理参数结合生成一个诺莫图模型(Nomogram Model).采用各类统计学方法进行预测能力评价.根据ARGS所计算的中位数进行分层的高低风险TNBC患者组中进行治疗药物敏感性的分析.CCK-8细胞活力实验与流式细胞术将用来分析TNBC细胞对治疗药物的敏感性.结果:我们构建了一个由7个基因组成的ARGS,并用于计算风险分数,将TNBC患者分为高风险和低风险组,高风险组患者比低风险组患者的总生存期(overall survival,OS)明显更差.随后生成一个具有优异性能的能对患者生存情况分层的诺莫图模型,预测出了高风险的TNBC患者对替尼类药物(酪氨酸激酶抑制剂)的敏感性更强.在体外实验中,我们发现细胞系风险分数越高,则其对替尼类药物的敏感性更强.结论:

作者:吴慕尧;刘奕显;郑婵娟;付淑君;邓锡云

来源:湖南师范大学学报(医学版) 2023 年 20卷 3期

知识库介绍

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作者:
吴慕尧;刘奕显;郑婵娟;付淑君;邓锡云
来源:
湖南师范大学学报(医学版) 2023 年 20卷 3期
标签:
三阴性乳腺癌 失巢凋亡 基因集 药物敏感性 triple-negative breast cancer anoikis gene signature tyrosine kinase inhibitors
目的:失巢凋亡(anoikis)是一种特殊类型的细胞凋亡,主要发生在细胞与基质联系丧失(失去锚定)时,对维护体内环境稳定起着重要的作用.本研究旨在构建一个在三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中与失巢凋亡相关的基因集以及预后模型,同时可以用于预测患者有效治疗药物.方法:对TCGA-BRCA数据集中的TNBC患者进行单因素和多因素Cox分析,以得出失巢凋亡相关基因集(anoikis-related gene signature,ARGS).采用Gene Expression Omnibus(GEO)数据集进行独立验证.将ARGS与临床病理参数结合生成一个诺莫图模型(Nomogram Model).采用各类统计学方法进行预测能力评价.根据ARGS所计算的中位数进行分层的高低风险TNBC患者组中进行治疗药物敏感性的分析.CCK-8细胞活力实验与流式细胞术将用来分析TNBC细胞对治疗药物的敏感性.结果:我们构建了一个由7个基因组成的ARGS,并用于计算风险分数,将TNBC患者分为高风险和低风险组,高风险组患者比低风险组患者的总生存期(overall survival,OS)明显更差.随后生成一个具有优异性能的能对患者生存情况分层的诺莫图模型,预测出了高风险的TNBC患者对替尼类药物(酪氨酸激酶抑制剂)的敏感性更强.在体外实验中,我们发现细胞系风险分数越高,则其对替尼类药物的敏感性更强.结论: