目的:2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)是一种由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的急性呼吸道传染病.SARS-CoV-2既可直接损伤心肌,也可通过激活免疫系统,引发细胞因子风暴,导致炎症细胞在心肌组织的浸润而损伤心肌.本研究基于测序数据分析SARS-CoV-2感染后人心肌细胞和巨噬细胞基因表达的变化,探讨SARS-CoV-2对心脏和免疫系统的潜在影响.方法:检索公共数据集GSE151879,采用在线软件Network Analyst对数据进行预处理,并进行感染组和对照组心肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞及巨噬细胞差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)[log2(fold change)>2,调整后P<0.05]的筛选.获取心肌细胞和巨噬细胞中表达模式一致的共同差异表达基因(consistent common differentially expressed genes,CCDEGs),利用在线分析软件String对其进行生物学功能和信号通路的富集分析.建立蛋白质交互作用网络、转录因子-基因交互网络、miRNA-基因交互网络和环境化学物-基因交互网络,并利用Cytoscape3.72进行可视化.结果:经标准化后的数据质量优秀,可确保分析结果可靠;心肌细胞感染SARS-CoV-2后,基因表达谱发生明显改变;成人心肌细胞中

作者：杨钰萌；王少薇；解昕轶；李俊杰；张荣强

来源：中南大学学报（医学版） 2021 年 46卷 11期