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目的:肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是临床高发的肾皮质肿瘤,谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidases,GPXs)基因对RCC的影响及作用机制尚不清楚.本研究旨在通过生物信息学分析探讨GPXs基因在RCC中的表达水平及其对患者预后的影响.方法:下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的公开数据,获取GPXs家族基因mRNA表达数据,采用非参数检验-K多个独立样本检验(Kruskal-Wallis检验)分析RCC患者和正常人群样本中GPXs家族基因的mRNA表达差异;利用UALCAN数据库分析肾透明细胞癌不同患者特征样本与正常人群样本中GPXs家族基因的蛋白质表达差异,评估GPXs家族基因在RCC中的作用;采用Kaplan-Meier Plotter在线分析不同类型RCC与总生存期(overall survival,OS)、无疾病生存期(disease-free survival,DFS)、疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)和无进展生存期(progression-free survival,PFS)的关系,根据GPX8基因表达水平绘制Kaplan-Meier生存曲线进一步研究GPX8基因表达水平与RCC患者预后的关系,基于多因素Cox回归分析结果,引入筛选的GPX8基因建立RCC的Nomogram列线图预测评分模型.结果:GPXs家族中GPX1、GPX4 mRNA在肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌患者中均显著高

作者:李娟;霍生杰;张荣强;史传道;孙娜;刘启玲

来源:中南大学学报(医学版) 2022 年 47卷 5期

知识库介绍

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李娟;霍生杰;张荣强;史传道;孙娜;刘启玲
来源:
中南大学学报(医学版) 2022 年 47卷 5期
标签:
肾细胞癌 谷胱甘肽过氧化物酶 预后 列线图
目的:肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是临床高发的肾皮质肿瘤,谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidases,GPXs)基因对RCC的影响及作用机制尚不清楚.本研究旨在通过生物信息学分析探讨GPXs基因在RCC中的表达水平及其对患者预后的影响.方法:下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的公开数据,获取GPXs家族基因mRNA表达数据,采用非参数检验-K多个独立样本检验(Kruskal-Wallis检验)分析RCC患者和正常人群样本中GPXs家族基因的mRNA表达差异;利用UALCAN数据库分析肾透明细胞癌不同患者特征样本与正常人群样本中GPXs家族基因的蛋白质表达差异,评估GPXs家族基因在RCC中的作用;采用Kaplan-Meier Plotter在线分析不同类型RCC与总生存期(overall survival,OS)、无疾病生存期(disease-free survival,DFS)、疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)和无进展生存期(progression-free survival,PFS)的关系,根据GPX8基因表达水平绘制Kaplan-Meier生存曲线进一步研究GPX8基因表达水平与RCC患者预后的关系,基于多因素Cox回归分析结果,引入筛选的GPX8基因建立RCC的Nomogram列线图预测评分模型.结果:GPXs家族中GPX1、GPX4 mRNA在肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌患者中均显著高