您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览18 | 下载9

[目的]探讨生物信息学筛选与子宫内膜异位症(EMT)早期诊断相关的 自噬差异表达基因(ATDEGs).[方法]使用limma包从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取EMT和健康对照组(healthy control,HC)的差异表达基因(DEGs),并进行GSEA富集分析.通过加权基因共表达网络分析获得与EMT相关的功能模块,并对功能模块中的基因进行功能(GO)和通路(KEGG)富集分析.从Genecards数据库下载了 ATDEGs.三部分取交集获取与EMT相关的ATDEGs,并构建了蛋白互作网络图;采用LASSO算法筛选出诊断基因,并通过受试者工作特征(ROC)曲线评估这些基因的诊断能力.[结果]本研究共计获得了 62个ATDEGs,并采用Cytoscape的MCODE插件找到了一个最显著的模块,其中包括17个枢纽基因;LASSO分析筛选出7个诊断基因,这些基因在外部数据集中得到了验证,提示其具有较好的诊断能力.[结论]本研究结果有助于EMT的早期诊断和干预,并为进一步的临床工作和机制研究提供了理论基础.

作者:沈战军;张玲;付凯丽;朱肄懿

来源:医学临床研究 2023 年 40卷 7期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:18 | 下载:9
作者:
沈战军;张玲;付凯丽;朱肄懿
来源:
医学临床研究 2023 年 40卷 7期
标签:
子宫内膜异位症/诊断 子宫内膜异位症/病因学 自噬/遗传学 基因 Endometriosis/DI Endometriosis/ET Autophagy/GE Genes
[目的]探讨生物信息学筛选与子宫内膜异位症(EMT)早期诊断相关的 自噬差异表达基因(ATDEGs).[方法]使用limma包从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取EMT和健康对照组(healthy control,HC)的差异表达基因(DEGs),并进行GSEA富集分析.通过加权基因共表达网络分析获得与EMT相关的功能模块,并对功能模块中的基因进行功能(GO)和通路(KEGG)富集分析.从Genecards数据库下载了 ATDEGs.三部分取交集获取与EMT相关的ATDEGs,并构建了蛋白互作网络图;采用LASSO算法筛选出诊断基因,并通过受试者工作特征(ROC)曲线评估这些基因的诊断能力.[结果]本研究共计获得了 62个ATDEGs,并采用Cytoscape的MCODE插件找到了一个最显著的模块,其中包括17个枢纽基因;LASSO分析筛选出7个诊断基因,这些基因在外部数据集中得到了验证,提示其具有较好的诊断能力.[结论]本研究结果有助于EMT的早期诊断和干预,并为进一步的临床工作和机制研究提供了理论基础.