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目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨鬼箭羽治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制.方法 通过文献查找、TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库及TCM@TAIWAN中医数据库筛选鬼箭羽主要成分及作用靶点,在Drugbank、TTD、OMIM、GeneCards数据库获取DKD相关靶点,利用Cytoscape软件分别构建"中药-成分-靶点""中药-成分-靶点-疾病"相互作用网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,并根据拓扑学参数筛选鬼箭羽治疗DKD的关键靶点;对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析,并构建"成分-靶点-通路"网络图,运用AutoDock Tools和Pymol将得到的主要活性成分与关键靶点进行分子对接.结果 共获得鬼箭羽有效成分14个,作用于564个潜在靶点,DKD靶点1106个,拓扑分析得到关键靶点41个,其中度值大于50的靶点有23个,包括IL-6、TNF、AKT1、VEGFA等.GO功能富集分析得到生物过程主要涉及氧化物的反应、活性氧的调控、细胞凋亡的调控等;KEGG通路富集分析主要包括AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、TNF信号通路等.分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素与4个核心靶点均具有较好的结合活性.结论 鬼箭羽可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素等多种活性成分作用于多个靶点,参与

作者:卜祥辉;安海燕;安晓娜;张承承;郭晓媛

来源:湖南中医药大学学报 2021 年 41卷 10期

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作者:
卜祥辉;安海燕;安晓娜;张承承;郭晓媛
来源:
湖南中医药大学学报 2021 年 41卷 10期
标签:
鬼箭羽;糖尿病肾病;网络药理学;分子对接;槲皮素;山柰酚;β-谷甾醇;木犀草素
目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨鬼箭羽治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制.方法 通过文献查找、TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库及TCM@TAIWAN中医数据库筛选鬼箭羽主要成分及作用靶点,在Drugbank、TTD、OMIM、GeneCards数据库获取DKD相关靶点,利用Cytoscape软件分别构建"中药-成分-靶点""中药-成分-靶点-疾病"相互作用网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,并根据拓扑学参数筛选鬼箭羽治疗DKD的关键靶点;对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析,并构建"成分-靶点-通路"网络图,运用AutoDock Tools和Pymol将得到的主要活性成分与关键靶点进行分子对接.结果 共获得鬼箭羽有效成分14个,作用于564个潜在靶点,DKD靶点1106个,拓扑分析得到关键靶点41个,其中度值大于50的靶点有23个,包括IL-6、TNF、AKT1、VEGFA等.GO功能富集分析得到生物过程主要涉及氧化物的反应、活性氧的调控、细胞凋亡的调控等;KEGG通路富集分析主要包括AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、TNF信号通路等.分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素与4个核心靶点均具有较好的结合活性.结论 鬼箭羽可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素等多种活性成分作用于多个靶点,参与