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目的 探索睾丸蛋白聚糖 2(sparc/osteonectin,cwcv and kazal-like domains proteoglycan 2,SPOCK2)在泛癌中的预后及免疫治疗反应中的作用.方法 基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(Clini-cal Proteomic Tumor Analysis Consortium,CPTAC)数据库检测SPOCK2 在肿瘤组织与正常组织中的表达差异,并通过人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库SPOCK2进行初步验证.关于SPOCK2对患者生存预后的影响采用Kaplan-Meier方法进行分析.采用基因富集工具进一步分析SPOCK2在肿瘤中参与的通路.最后通过桑格数据库研究SPOCK2与免疫细胞及免疫相关基因的关系.结果 SPOCK2 在 14种肿瘤中高表达,在 12种肿瘤中低表达,且HPA数据库显示在肝细胞性肝癌、甲状腺癌、皮肤黑色素瘤及卵巢浆液性囊腺癌中SPOCK2 高表达,与基因表达水平分析结果一致.生存分析结果表明SPOCK2 高表达在多种肿瘤中预示预后良好.富集分析发现SPOCK2 参与T细胞和辅助性T细胞的分化和激活过程.此外,与免疫浸润细胞的相关性分析显示SPOCK2 水平与多数肿瘤中的B淋巴细胞、CD4+ T淋巴细胞、CD8+ T淋巴细胞和树突状细胞等免疫细胞浸润呈正相关.SPOCK2的表达水平与免疫调节因子和免疫检查点相关基因存在密切

作者:冯忘忧;姜东伯;徐盈;李佳;杨红

来源:湖南中医药大学学报 2023 年 43卷 11期

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作者:
冯忘忧;姜东伯;徐盈;李佳;杨红
来源:
湖南中医药大学学报 2023 年 43卷 11期
标签:
TCGA 免疫治疗 SPOCK2 泛癌 预后 免疫微环境 The Cancer Genome Atlas immunotherapy sparc/osteonectin,cwcv,and kazal-like domains proteoglycan 2 pan-cancer prognosis immune microenvironment
目的 探索睾丸蛋白聚糖 2(sparc/osteonectin,cwcv and kazal-like domains proteoglycan 2,SPOCK2)在泛癌中的预后及免疫治疗反应中的作用.方法 基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(Clini-cal Proteomic Tumor Analysis Consortium,CPTAC)数据库检测SPOCK2 在肿瘤组织与正常组织中的表达差异,并通过人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库SPOCK2进行初步验证.关于SPOCK2对患者生存预后的影响采用Kaplan-Meier方法进行分析.采用基因富集工具进一步分析SPOCK2在肿瘤中参与的通路.最后通过桑格数据库研究SPOCK2与免疫细胞及免疫相关基因的关系.结果 SPOCK2 在 14种肿瘤中高表达,在 12种肿瘤中低表达,且HPA数据库显示在肝细胞性肝癌、甲状腺癌、皮肤黑色素瘤及卵巢浆液性囊腺癌中SPOCK2 高表达,与基因表达水平分析结果一致.生存分析结果表明SPOCK2 高表达在多种肿瘤中预示预后良好.富集分析发现SPOCK2 参与T细胞和辅助性T细胞的分化和激活过程.此外,与免疫浸润细胞的相关性分析显示SPOCK2 水平与多数肿瘤中的B淋巴细胞、CD4+ T淋巴细胞、CD8+ T淋巴细胞和树突状细胞等免疫细胞浸润呈正相关.SPOCK2的表达水平与免疫调节因子和免疫检查点相关基因存在密切