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目的: 观察溃疡性结肠炎(UC)和肠易激综合征(IBS)之间基因表达上的差异, 从基因水平探讨UC的病理机制及其与IBS的区别.方法: 从GEO下载UC和IBS基因芯片资料, 用BRB-ArrayTools 3.6软件对该数据进行挖掘,并对差异表达基因进行生物信息学分析.结果: 两者具有131条差异基因, 涉及炎症反应、免疫、信号传导、细胞外分泌、基因转录调节、细胞结构、细胞死亡等. 与IBS 相比,UC上调基因124条, 下调基因7条. 聚类分析发现, 两类样品可根据基因表达进行区分.结论: 与IBS相比, UC肠黏膜在炎症、分泌、细胞生长和增殖等的相关基因表达增高;利用基因芯片能够对两种疾病进行区别.

作者:陈玉龙;苗艳艳;吕翠田

来源:世界华人消化杂志 2009 年 17卷 35期

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作者:
陈玉龙;苗艳艳;吕翠田
来源:
世界华人消化杂志 2009 年 17卷 35期
标签:
溃疡性结肠炎 肠易激综合征 基因芯片 数据挖掘
目的: 观察溃疡性结肠炎(UC)和肠易激综合征(IBS)之间基因表达上的差异, 从基因水平探讨UC的病理机制及其与IBS的区别.方法: 从GEO下载UC和IBS基因芯片资料, 用BRB-ArrayTools 3.6软件对该数据进行挖掘,并对差异表达基因进行生物信息学分析.结果: 两者具有131条差异基因, 涉及炎症反应、免疫、信号传导、细胞外分泌、基因转录调节、细胞结构、细胞死亡等. 与IBS 相比,UC上调基因124条, 下调基因7条. 聚类分析发现, 两类样品可根据基因表达进行区分.结论: 与IBS相比, UC肠黏膜在炎症、分泌、细胞生长和增殖等的相关基因表达增高;利用基因芯片能够对两种疾病进行区别.