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目的 利用基因芯片数据识别与结肠癌相关的特征基因,对该疾病的临床诊断和生物医学研究起到有益的参考和借鉴作用.方法 本文建议了一种称为k均值分类信息指数(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)的特征基因提取方法.该方法首先对基因芯片上的所有基因进行聚类分析,然后挑选出每一类的"主基因",最后以支持向量机为分类工具进行样本类型的判别,以其在训练集和测试集上的错误分类率为依据选取特征基因.结果 先以结肠癌基因表达谱数据为例进行试验,提取到22个基因,分类正确率达到86.4

作者:张娅;饶妮妮;王敏;徐尚蕾

来源:航天医学与医学工程 2008 年 21卷 4期

知识库介绍

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作者:
张娅;饶妮妮;王敏;徐尚蕾
来源:
航天医学与医学工程 2008 年 21卷 4期
标签:
基因表达谱 聚类 信息分类指数 支持向量机
目的 利用基因芯片数据识别与结肠癌相关的特征基因,对该疾病的临床诊断和生物医学研究起到有益的参考和借鉴作用.方法 本文建议了一种称为k均值分类信息指数(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)的特征基因提取方法.该方法首先对基因芯片上的所有基因进行聚类分析,然后挑选出每一类的"主基因",最后以支持向量机为分类工具进行样本类型的判别,以其在训练集和测试集上的错误分类率为依据选取特征基因.结果 先以结肠癌基因表达谱数据为例进行试验,提取到22个基因,分类正确率达到86.4