目的:利用生物信息学方法对女性肺腺癌肿瘤组织及正常组织的差异表达基因进行筛选及分析,筛选出女性肺腺癌发生发展的关键基因,并为后续研究提供候选基因.方法:从GEO数据库中下载肺腺癌基因芯片数据集 GSE19804、GSE40791、GSE31210、GSE7670、GSE10072、GSE32863、GSE75037,利用在线工具GEO2R筛选出数据集中正常女性肺组织和女性肺腺癌组织的差异表达基因(DEGs),然后利用DAVID数据库对DEGs进行GO和KEGG富集分析,接着利用STRING和Cytoscape软件构建蛋白互相网络(PPI)并筛选出Hub基因,并利用oncomine、U ALCAN数据库进行验证,最后使用Kaplan-Meier plotter数据库对筛选出的Hub基因进行生存分析.结果:在7个数据集中共筛选出276个DEGs,其中69个上调,207个下调.共筛选出CDC20、CENPF、KIAA0101、TOP2A、ASPM、TYMS、MCM4、NUSAP1、MELK、UBE2C 等 10 个 Hub 基因,Kaplan-Meier 生存分析显示除ASPM外,其余9个均与女性肺腺癌的总体生存率相关.结论:最终筛选出的10个Hub基因可能与女性肺腺癌的发生发展密切相关,其可能是女性肺腺癌发病机制、预后判断和治疗研究的新靶点.
作者：李琦；王梅芳；唐以军
来源：武汉大学学报（医学版） 2022 年 43卷 3期
