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目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势.方法:选取2019年12月至2021年10月在武汉大学中南医院收治的70例重症肺炎患者,所有患者均已行mNGS和传统培养(肺泡灌洗液培养、痰培养),回顾性分析mNGS在重症肺炎患者中病原体检测的优势.结果:mNGS病原体检测的阳性率高于传统培养(98.6%vs62.9%,P<0.001).在传统培养阴性而mNGS阳性的患者中,mNGS能进一步识别出多种病原体感染.在病原体分布上,mNGS检出细菌71株、真菌39株和病毒3株.在混合感染中,mNGS诊断阳性率更高(67.1%vs 12.9%,P<0.001).此外,在合并基础疾病的患者中,mNGS有更高的病原体检出率(98.0%vs69.4%,P<0.001),尤其在合并免疫低下的患者中,mNGS可识别出特殊病原体(肺孢子菌、巨细胞病毒)感染.结论:mNGS可以提高重症肺炎患者病原微生物的检出率,可作为传统培养阴性的重症肺炎患者的补充检测技术.mNGS在混合感染诊断中有优势,能同时识别多种病原体感染.临床上,推荐合并免疫缺陷的重症肺炎患者尽早应用mNGS,增加临床获益.

作者:周小莲;杨炯

来源:武汉大学学报(医学版) 2023 年 44卷 5期

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作者:
周小莲;杨炯
来源:
武汉大学学报(医学版) 2023 年 44卷 5期
标签:
宏基因组二代测序 重症肺炎 肺泡灌洗液 病原体检测 优势
目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势.方法:选取2019年12月至2021年10月在武汉大学中南医院收治的70例重症肺炎患者,所有患者均已行mNGS和传统培养(肺泡灌洗液培养、痰培养),回顾性分析mNGS在重症肺炎患者中病原体检测的优势.结果:mNGS病原体检测的阳性率高于传统培养(98.6%vs62.9%,P<0.001).在传统培养阴性而mNGS阳性的患者中,mNGS能进一步识别出多种病原体感染.在病原体分布上,mNGS检出细菌71株、真菌39株和病毒3株.在混合感染中,mNGS诊断阳性率更高(67.1%vs 12.9%,P<0.001).此外,在合并基础疾病的患者中,mNGS有更高的病原体检出率(98.0%vs69.4%,P<0.001),尤其在合并免疫低下的患者中,mNGS可识别出特殊病原体(肺孢子菌、巨细胞病毒)感染.结论:mNGS可以提高重症肺炎患者病原微生物的检出率,可作为传统培养阴性的重症肺炎患者的补充检测技术.mNGS在混合感染诊断中有优势,能同时识别多种病原体感染.临床上,推荐合并免疫缺陷的重症肺炎患者尽早应用mNGS,增加临床获益.