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目的 探索srtA基因编码的转肽酶sortase A(SrtA)影响变异链球菌致龋性的机制.方法 采用基于1H核磁共振波谱(NMR)的代谢组学方法,比较野生型变异链球菌UA159与srtA基因缺陷型变异链球菌UA159的胞外代谢产物;联合使用主成分分析和正交偏最小二乘法—判别分析鉴定不同菌株之间代谢产物的差异.结果 大多数有差异性的代谢产物是未知的,可识别的差异性代谢产物有亮氨酸和缬氨酸(δ 0.92× 10-6~1.20× 10-6)、乳酸(δ 1.28× 10-6)、酮戊二酸(δ 3.00× 10-6)、甘氨酸(δ 3.60×10-6).结论 在进一步完善微生物代谢产物数据库的基础上,1H NMR代谢组学可用于龋病病因的研究.

作者:宋颖;周京琳;何远丽;李伟;邹玲

来源:华西口腔医学杂志 2018 年 36卷 4期

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作者:
宋颖;周京琳;何远丽;李伟;邹玲
来源:
华西口腔医学杂志 2018 年 36卷 4期
标签:
代谢组学 变异链球菌 sortase A 1H核磁共振波谱 主成分分析 正交偏最小二乘法—判别分析
目的 探索srtA基因编码的转肽酶sortase A(SrtA)影响变异链球菌致龋性的机制.方法 采用基于1H核磁共振波谱(NMR)的代谢组学方法,比较野生型变异链球菌UA159与srtA基因缺陷型变异链球菌UA159的胞外代谢产物;联合使用主成分分析和正交偏最小二乘法—判别分析鉴定不同菌株之间代谢产物的差异.结果 大多数有差异性的代谢产物是未知的,可识别的差异性代谢产物有亮氨酸和缬氨酸(δ 0.92× 10-6~1.20× 10-6)、乳酸(δ 1.28× 10-6)、酮戊二酸(δ 3.00× 10-6)、甘氨酸(δ 3.60×10-6).结论 在进一步完善微生物代谢产物数据库的基础上,1H NMR代谢组学可用于龋病病因的研究.