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目的 利用DIPS-PCR方法建立宫颈癌组织HPV16病毒整合位点图谱,并利用软件分析存在的优势整合位点及整合位点处启动子序列.方法 细胞培养Siha细胞株,PCR扩增并筛选出单一HPV16感染的临床标本,利用DIPS-PCR方法检测Siha细胞株和单一HPV16感染的临床宫颈癌标本中病毒整合位点.结果 发现Siha细胞株HPV16整合位点13q22;宫颈癌组织整合位点在1、3、5、6、8、10、11、13、14、15、17、19及X染色体上,整合位点在染色体的分布是随机的,但其多集中于染色体脆性部位及其附近区域.整合位点多见于1p35.1、5p15.3、10q24、13q21~q22、Xp11.4.利用CBS prediction servers和BDGP Neural Network Promoter prediction软件分析发现整合位点存在高度疑似启动子序列.结论 DIPS-PCR在DNA水平可有效检测宫颈癌组织和Siha细胞株HPV16整合位点,整合位点多出现在染色体的脆性位点处,且该脆性部位可能存在某些使病毒癌基因过度表达的启动子序列.

作者:陈琳;郑莹

来源:四川大学学报(医学版) 2016 年 47卷 4期

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作者:
陈琳;郑莹
来源:
四川大学学报(医学版) 2016 年 47卷 4期
标签:
宫颈癌 高危型人乳头瘤病毒 DIPS-PCR 整合 脆性位点 启动子 Cervical carcinoma High-risk human papillomavirus DIPS-PCR Integration Fragile sites Promoters
目的 利用DIPS-PCR方法建立宫颈癌组织HPV16病毒整合位点图谱,并利用软件分析存在的优势整合位点及整合位点处启动子序列.方法 细胞培养Siha细胞株,PCR扩增并筛选出单一HPV16感染的临床标本,利用DIPS-PCR方法检测Siha细胞株和单一HPV16感染的临床宫颈癌标本中病毒整合位点.结果 发现Siha细胞株HPV16整合位点13q22;宫颈癌组织整合位点在1、3、5、6、8、10、11、13、14、15、17、19及X染色体上,整合位点在染色体的分布是随机的,但其多集中于染色体脆性部位及其附近区域.整合位点多见于1p35.1、5p15.3、10q24、13q21~q22、Xp11.4.利用CBS prediction servers和BDGP Neural Network Promoter prediction软件分析发现整合位点存在高度疑似启动子序列.结论 DIPS-PCR在DNA水平可有效检测宫颈癌组织和Siha细胞株HPV16整合位点,整合位点多出现在染色体的脆性位点处,且该脆性部位可能存在某些使病毒癌基因过度表达的启动子序列.