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目的 分析浙江省2009-2013年初甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因(NA)序列进化特征.方法 提取浙江省2009-2013年初29株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NA基因,测序并拼接出ORF.以浙江省不同年份与地域15份代表性毒株NA序列和GenBank数据库中选取的22株2009-2012年国内外甲型H1N1流感病毒NA基因序列,采用MEGA 5.1软件对其进行序列比对并构建种系发生树.结果 扩增并测序获得29株甲型H1N1流感病毒的NA基因ORF的全长序列,与国内外甲型H1N1流感病毒NA序列比对后显示序列的同源性较高,浙江省毒株与北美早期甲型H1N1流感病毒典型代表株A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.20% ~99.50%,其中采集于2012年末和2013年初的4份病毒NA与A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.63% ~99.14%.在1株采集于2010年1月的甲型H1N1流感病毒NA的基因序列中发现可导致奥司他韦耐药的H275Y突变基因型.结论 虽然浙江省后期的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因累积了更多的变异,但所有毒株之间基因同源性仍然较高,所有毒株的神经氨酸酶基因同源性达到98.20%及以上,序列分析结果证实1份毒株携带奥司他韦耐药基因型突变.

作者:陈寅;茅海燕;周敏;李榛;严菊英;张严峻;卢亦愚

来源:疾病监测 2013 年 28卷 10期

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作者:
陈寅;茅海燕;周敏;李榛;严菊英;张严峻;卢亦愚
来源:
疾病监测 2013 年 28卷 10期
标签:
甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶 序列分析 种系发生树 influenza A (H1N1) pdm09 virus neuraminidase sequence analysis phylogenetic tree
目的 分析浙江省2009-2013年初甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因(NA)序列进化特征.方法 提取浙江省2009-2013年初29株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NA基因,测序并拼接出ORF.以浙江省不同年份与地域15份代表性毒株NA序列和GenBank数据库中选取的22株2009-2012年国内外甲型H1N1流感病毒NA基因序列,采用MEGA 5.1软件对其进行序列比对并构建种系发生树.结果 扩增并测序获得29株甲型H1N1流感病毒的NA基因ORF的全长序列,与国内外甲型H1N1流感病毒NA序列比对后显示序列的同源性较高,浙江省毒株与北美早期甲型H1N1流感病毒典型代表株A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.20% ~99.50%,其中采集于2012年末和2013年初的4份病毒NA与A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.63% ~99.14%.在1株采集于2010年1月的甲型H1N1流感病毒NA的基因序列中发现可导致奥司他韦耐药的H275Y突变基因型.结论 虽然浙江省后期的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因累积了更多的变异,但所有毒株之间基因同源性仍然较高,所有毒株的神经氨酸酶基因同源性达到98.20%及以上,序列分析结果证实1份毒株携带奥司他韦耐药基因型突变.