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目的 了解浙江省2008-2013年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)患者中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox A16)的流行株VP1区基因特征.方法 对浙江省2008-2013年手足口病患者粪便、疱疹液和咽拭子标本中分离到的Cox A16毒株用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)进行VP1区特异性基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定并参考Cox A16的参考毒株和中国其他地区的Cox A16分离毒株进行同源性分析和构建系统发生树.结果 浙江省2008-2013年的81株Cox A16分离株,其VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是88.7% ~ 100%和97.8%~100%.与原型株G10(G-10/RSA/1951)的VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是61.9% ~ 65.1%和90.1% ~ 91.7%.81株Cox A16分离株全部属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个基因亚型.结论 浙江地区2008-2013年分离到的81株Cox A16分离株属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环.

作者:葛琼;龚黎明;茅海燕;张严峻;陈寅;李榛

来源:疾病监测 2015 年 30卷 4期

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作者:
葛琼;龚黎明;茅海燕;张严峻;陈寅;李榛
来源:
疾病监测 2015 年 30卷 4期
标签:
肠道病毒 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 基因型 Enterovirus Hand foot and mouth disease Coxsackievirus A16 virus Genotype
目的 了解浙江省2008-2013年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)患者中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox A16)的流行株VP1区基因特征.方法 对浙江省2008-2013年手足口病患者粪便、疱疹液和咽拭子标本中分离到的Cox A16毒株用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)进行VP1区特异性基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定并参考Cox A16的参考毒株和中国其他地区的Cox A16分离毒株进行同源性分析和构建系统发生树.结果 浙江省2008-2013年的81株Cox A16分离株,其VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是88.7% ~ 100%和97.8%~100%.与原型株G10(G-10/RSA/1951)的VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是61.9% ~ 65.1%和90.1% ~ 91.7%.81株Cox A16分离株全部属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个基因亚型.结论 浙江地区2008-2013年分离到的81株Cox A16分离株属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环.