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目的 了解2015-2019年湖北省甲型H1N1流感病毒流行和进化特征、抗原表位和耐药位点突变情况.方法 在中国流感监测信息系统下载流感病毒核酸检测阳性率并划分流行高峰,选取2015-2019年湖北省39株经实时荧光PCR检测阳性后病毒分离培养的甲型H1N1流感病毒株并测序,另在全球流感共享数据库下载13株湖北省毒株序列,采用生物信息学软件分析其进化簇分布、抗原表位和耐药突变位点,通过三维建模,分析其突变位点结构.结果 2015-2019年湖北省甲型H1N1流感病毒每年流行高峰持续长达11~14周,流行强度逐年增加,在血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)进化树6B簇内进化出6B.1A到6B.1A7等多个分支,发现12处HA抗原表位突变位点和2处NA基因耐药位点,其中毒力标签D222G和耐药位点I223V三维模拟结构差异明显.结论 2015-2019年甲型H1N1流感病毒流行强度不断提高,进化出多个分支簇,零星检出毒力标签和耐药突变位点,该分析有助于提高湖北省流感病毒流行病学和基因进化监测水平.

作者:方斌;徐晖;余晓;李翔;叶国军;刘琳琳

来源:疾病监测 2019 年 34卷 11期

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作者:
方斌;徐晖;余晓;李翔;叶国军;刘琳琳
来源:
疾病监测 2019 年 34卷 11期
标签:
甲型H1N1流感 病毒 进化 抗原表位 耐药位点
目的 了解2015-2019年湖北省甲型H1N1流感病毒流行和进化特征、抗原表位和耐药位点突变情况.方法 在中国流感监测信息系统下载流感病毒核酸检测阳性率并划分流行高峰,选取2015-2019年湖北省39株经实时荧光PCR检测阳性后病毒分离培养的甲型H1N1流感病毒株并测序,另在全球流感共享数据库下载13株湖北省毒株序列,采用生物信息学软件分析其进化簇分布、抗原表位和耐药突变位点,通过三维建模,分析其突变位点结构.结果 2015-2019年湖北省甲型H1N1流感病毒每年流行高峰持续长达11~14周,流行强度逐年增加,在血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)进化树6B簇内进化出6B.1A到6B.1A7等多个分支,发现12处HA抗原表位突变位点和2处NA基因耐药位点,其中毒力标签D222G和耐药位点I223V三维模拟结构差异明显.结论 2015-2019年甲型H1N1流感病毒流行强度不断提高,进化出多个分支簇,零星检出毒力标签和耐药突变位点,该分析有助于提高湖北省流感病毒流行病学和基因进化监测水平.