目的 分析扬州市戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的基因特征.方法 采用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-nested polymerase chain reaction,RT-nPCR)法筛选人抗戊型肝炎(hepatitis E,HE)病毒抗体免疫球蛋白m(immunoglobulin m,IgM)阳性血清和猪肝组织样品,套式RT-PCR扩增HEV RNA ORF2片段基因并测序,DNA Star MegAlign比对核苷酸构建距离矩阵和系统发生树.结果 筛查并扩增6株基因4型HEV病毒,核苷酸同源性89.9%~99.3%,与基因4型参考株的同源性为85.8%~94.6%,与其他基因型的同源性为79.1% ~ 89.2%,遗传进化显示扬州市6株病毒分在3个基因亚型分支上,与基因2型和3型的遗传距离大于基因1型.结论 扬州地区人源和猪源HEV同源性高,HE的传染源是猪的可能性大.
作者:肖越胜;张军;黄瑶;姜辉
来源:中华疾病控制杂志 2014 年 18卷 7期