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目的 初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)和原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的共同基因表达特征和分子机制.方法 利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取SLE和pSS基因表达数据集,进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和差异表达基因分析(differenti-ally expressed genes,DEGs),初步确认SLE和pSS的共同关键基因和基因表达特征.结果 WGCNA和DEGs分析结果都显示SLE和pSS的共同基因主要富集在Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)和病毒免疫相关的通路上(均有P<0.05);分析得到9个关键基因,分别是ISG15、IFIT3、OASL、OAS2、SERPING1、GBP1、DDX60、XAF1和DDX58,其中大部分是Ⅰ型IFN相关基因.结论 研究结果提示SLE和pSS的共同基因表达特征主要与Ⅰ型IFN和病毒免疫相关基因以及通路有关,这为未来的机制研究提供了一定的参考.

作者:凌华云;吴玲玲;周颖;邱丽娟;王红;薛昱;陈慧娟;王廷睿;王斌

来源:中华疾病控制杂志 2022 年 26卷 6期

知识库介绍

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作者:
凌华云;吴玲玲;周颖;邱丽娟;王红;薛昱;陈慧娟;王廷睿;王斌
来源:
中华疾病控制杂志 2022 年 26卷 6期
标签:
系统性红斑狼疮 原发性干燥综合征 Ⅰ型干扰素 加权基因共表达网络分析 差异表达基因分析
目的 初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)和原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的共同基因表达特征和分子机制.方法 利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取SLE和pSS基因表达数据集,进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和差异表达基因分析(differenti-ally expressed genes,DEGs),初步确认SLE和pSS的共同关键基因和基因表达特征.结果 WGCNA和DEGs分析结果都显示SLE和pSS的共同基因主要富集在Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)和病毒免疫相关的通路上(均有P<0.05);分析得到9个关键基因,分别是ISG15、IFIT3、OASL、OAS2、SERPING1、GBP1、DDX60、XAF1和DDX58,其中大部分是Ⅰ型IFN相关基因.结论 研究结果提示SLE和pSS的共同基因表达特征主要与Ⅰ型IFN和病毒免疫相关基因以及通路有关,这为未来的机制研究提供了一定的参考.