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目的 通过生物信息学(生信学)分析在肝细胞癌(HCC)中SLC4A10的表达对HCC患者预后的影响,初步验证并探讨其意义.方法 通过TCGA数据库,分析SLC4A10在HCC组织与正常组织间的差异表达,并利用实时定量PCR进行验证.运用Kaplan-Meier(K-M)曲线分析SLC4A10的表达量对HCC患者预后的影响;通过单因素与多因素回归分析SLC4A10与HCC患者总生存期(CS)和无病生存期(DFS)的相关性;通过PPI数据库构建蛋白互作网络并进行功能富集分析,探索SLC4A10在HCC中的调控机制.结果 通过生信学分析发现,SLC4A10在HCC组织中的表达显著低于正常组织;SLC4A10 mRNA表达降低与晚期临床病理参数显著相关,并降低HCC患者的CS和DFS;功能富集分析显示SLC4A10参与的重要的生物过程包括跨上皮转运、细胞体积稳态和钠离子跨膜导入.结论 通过生信学分析提示SLC4A10在HCC中表达降低,其高表达利于HCC患者的预后,可能是HCC的潜在预后标志物或治疗靶点.

作者:黄容;张键;车旭

来源:基础医学与临床 2022 年 42卷 3期

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作者:
黄容;张键;车旭
来源:
基础医学与临床 2022 年 42卷 3期
标签:
肝细胞肝癌(HCC);SLC4A10;预后;标志物
目的 通过生物信息学(生信学)分析在肝细胞癌(HCC)中SLC4A10的表达对HCC患者预后的影响,初步验证并探讨其意义.方法 通过TCGA数据库,分析SLC4A10在HCC组织与正常组织间的差异表达,并利用实时定量PCR进行验证.运用Kaplan-Meier(K-M)曲线分析SLC4A10的表达量对HCC患者预后的影响;通过单因素与多因素回归分析SLC4A10与HCC患者总生存期(CS)和无病生存期(DFS)的相关性;通过PPI数据库构建蛋白互作网络并进行功能富集分析,探索SLC4A10在HCC中的调控机制.结果 通过生信学分析发现,SLC4A10在HCC组织中的表达显著低于正常组织;SLC4A10 mRNA表达降低与晚期临床病理参数显著相关,并降低HCC患者的CS和DFS;功能富集分析显示SLC4A10参与的重要的生物过程包括跨上皮转运、细胞体积稳态和钠离子跨膜导入.结论 通过生信学分析提示SLC4A10在HCC中表达降低,其高表达利于HCC患者的预后,可能是HCC的潜在预后标志物或治疗靶点.