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目的 探讨新型冠状病毒在治疗初期和治疗后期的核酸检测情况,分析假阴性结果出现的实验因素.方法 所有样本来源于1例COVID-19确诊病例患者在住院治疗期间,入院后治疗的前6 d设为治疗初期,这期间送检的6个鼻咽拭子编号为1、2、3、4、5、6,设为A组.在出院前一周的治疗设为治疗后期,这期间送检的6个鼻咽拭子编号为7、8、9、10、11、12,设为B组.将A组和B组的12个样本充分混匀后,每个样本以每管200 ul的液量分装到四个不同的1.5 mL EP管中,第一管即刻加样提取,第二管静置5 min加样提取,第三管静置15 min加样提取,第四管静置30 min加样提取,RT-PCR扩增.用Pearson积矩相关分析比较A组的N基因和ORF1ab基因Ct值的相关系数,并用MedCalc软件绘制Bland-Altman曲线进行一致性分析.用Excel 2016比较B组的结果.结果 治疗初期A组N基因Ct值0 min与其余3种静置时间两两比较,结果具有较好的一致性;而ORF1ab基因Ct值0 min与30 min 一致性较差.治疗后期B组中同一个样本的N基因和ORF1ab基因在加样提取前因静置时间不同而出现不同的结果,甚至出现了假阴性结果.结论 样本静置时间对扩增检测结果有影响,治疗后期和疑似患者的样本应充分震荡并静置30 min后再进行提取和扩增实验.

作者:梁丽霞

来源:实验与检验医学 2023 年 41卷 4期

知识库介绍

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作者:
梁丽霞
来源:
实验与检验医学 2023 年 41卷 4期
标签:
新型冠状病毒 核酸检测 静置时间 提取 假阴性 SARS-CoV-2 Nucleic acid testing Standing time RNA extraction False negative results
目的 探讨新型冠状病毒在治疗初期和治疗后期的核酸检测情况,分析假阴性结果出现的实验因素.方法 所有样本来源于1例COVID-19确诊病例患者在住院治疗期间,入院后治疗的前6 d设为治疗初期,这期间送检的6个鼻咽拭子编号为1、2、3、4、5、6,设为A组.在出院前一周的治疗设为治疗后期,这期间送检的6个鼻咽拭子编号为7、8、9、10、11、12,设为B组.将A组和B组的12个样本充分混匀后,每个样本以每管200 ul的液量分装到四个不同的1.5 mL EP管中,第一管即刻加样提取,第二管静置5 min加样提取,第三管静置15 min加样提取,第四管静置30 min加样提取,RT-PCR扩增.用Pearson积矩相关分析比较A组的N基因和ORF1ab基因Ct值的相关系数,并用MedCalc软件绘制Bland-Altman曲线进行一致性分析.用Excel 2016比较B组的结果.结果 治疗初期A组N基因Ct值0 min与其余3种静置时间两两比较,结果具有较好的一致性;而ORF1ab基因Ct值0 min与30 min 一致性较差.治疗后期B组中同一个样本的N基因和ORF1ab基因在加样提取前因静置时间不同而出现不同的结果,甚至出现了假阴性结果.结论 样本静置时间对扩增检测结果有影响,治疗后期和疑似患者的样本应充分震荡并静置30 min后再进行提取和扩增实验.