目的 探讨唾液腺腺样囊性癌(SACC)潜在的微小RNAs(miRNAs)分子标志物,构建miRNA-mRNA调控网络,并阐明其潜在的分子机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载2个SACC的微阵列芯片数据,通过R语言进行分析差异的miRNAs与mRNA.应用FunRich 3.1.3软件对差异miRNA进行转录因子富集分析以及预测差异miRNAs的靶基因.对SACC中差异miRNAs的靶基因进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以及蛋白互作分析.使用Cytoscape 3.7.0构建miRNA-mRNA调控网络.结果 1.共筛选出144个差异表达的miRNAs(DEMs)和1216个差异表达的mRNAs(DEGs);2.KEGG信号通路富集分析发现,靶基因主要参与Rap1信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路以及肌动蛋白细胞骨架的调节;3.STRING蛋白相互作用分析发现,ACSL1、SCD、MGLL、FABP4在蛋白相互作用网络中处于核心地位.结论 我们筛选出SACC与相对正常组织间差异明显的miRNA和mRNA,并分析发现了这些差异分子主要参与的信号通路和功能.
作者:刘发煇;侯婉云;梁家东;徐晶晶;罗春英
来源:解剖学报 2021 年 52卷 4期