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目的:通过对临床少见丝状真菌的分离和分析鉴定,探讨尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉、茄病镰刀菌等临床不常见丝状真菌的实验诊断方法,为临床明确诊断真菌感染种类提供科学依据。方法从临床标本培养出的5株真菌用形态学方法未能作出准确鉴定,通过聚合酶链反应(PCR)和基因测序方法分析核糖体转录间隔区域 ITS 和 ITS2序列,在 NCBI 网站应用 Blastn 对获得的基因序列进行同源性分析及利用 GenBank 中的系统发育软件自动生成系统发育树,以确定丝状真菌的种。结果rDNA-ITS 序列分析结合形态学分析,5株菌均可鉴定到种的水平,鉴定结果分别是:尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉和茄病镰刀菌。结论传统形态学方法,极易受检验人员经验水平影响,对于罕见菌株甚至不能作出鉴定,利用真菌的 ITS 序列的特异性,可快速、准确将大部分丝状真菌鉴定到种水平。

作者:尹秀云;梁钰英;于农;曾利军;李一鹤;蒋虔;徐建民;杨哲;李好莲;陈建魁;陈水平

来源:军事医学 2015 年 11期

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作者:
尹秀云;梁钰英;于农;曾利军;李一鹤;蒋虔;徐建民;杨哲;李好莲;陈建魁;陈水平
来源:
军事医学 2015 年 11期
标签:
rDNA 丝状真菌 内转录间隔区 形态学鉴定 序列分析 rDNA filamentous fungi ITS2 morphological identification sequence analysis
目的:通过对临床少见丝状真菌的分离和分析鉴定,探讨尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉、茄病镰刀菌等临床不常见丝状真菌的实验诊断方法,为临床明确诊断真菌感染种类提供科学依据。方法从临床标本培养出的5株真菌用形态学方法未能作出准确鉴定,通过聚合酶链反应(PCR)和基因测序方法分析核糖体转录间隔区域 ITS 和 ITS2序列,在 NCBI 网站应用 Blastn 对获得的基因序列进行同源性分析及利用 GenBank 中的系统发育软件自动生成系统发育树,以确定丝状真菌的种。结果rDNA-ITS 序列分析结合形态学分析,5株菌均可鉴定到种的水平,鉴定结果分别是:尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉和茄病镰刀菌。结论传统形态学方法,极易受检验人员经验水平影响,对于罕见菌株甚至不能作出鉴定,利用真菌的 ITS 序列的特异性,可快速、准确将大部分丝状真菌鉴定到种水平。