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利用本地Blast,将灰盖鬼伞的高速泳动族蛋白(high-mobility-group box,HMGB)编码基因exp与草菇PYd21基因组进行比对,找到一个exp的同源基因vv-exp.克隆测序PYd21与PYd15两单孢菌株中vv-exp基因并进行比对,结果表明2个菌株的vv-exp基因序列一致.结合本实验室草菇转录组数据对vv-exp基因结构进行分析,结果显示此基因全长为1 937bp,共含3个内含子;开放阅读框长度为1 773bp,编码590个氨基酸.预测的氨基酸序列生物信息学分析结果表明,此基因编码的蛋白含有两个HMG-box结构域.通过实时荧光定量PCR (quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)方法分析了vv-exp基因在草菇不同生长阶段以及不同部位的表达量,结果显示该基因在原基表达量较高,表明此基因可能与草菇子实体的形成有关;另外,在成熟期菌盖中vv-exp表达量比原基上调达到3倍以上,且显著高于伸长期菌盖,由此推断该基因参与调控草菇子实体开伞.

作者:卢园萍;连玲丹;郭丽(石羡);严俊杰;谢斌;王威;谢宝贵

来源:菌物学报 2015 年 34卷 4期

知识库介绍

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作者:
卢园萍;连玲丹;郭丽(石羡);严俊杰;谢斌;王威;谢宝贵
来源:
菌物学报 2015 年 34卷 4期
标签:
菌丝 原基 食用真菌 纽扣期 转录组 mycelium primordium edible fungi button stage transcriptome
利用本地Blast,将灰盖鬼伞的高速泳动族蛋白(high-mobility-group box,HMGB)编码基因exp与草菇PYd21基因组进行比对,找到一个exp的同源基因vv-exp.克隆测序PYd21与PYd15两单孢菌株中vv-exp基因并进行比对,结果表明2个菌株的vv-exp基因序列一致.结合本实验室草菇转录组数据对vv-exp基因结构进行分析,结果显示此基因全长为1 937bp,共含3个内含子;开放阅读框长度为1 773bp,编码590个氨基酸.预测的氨基酸序列生物信息学分析结果表明,此基因编码的蛋白含有两个HMG-box结构域.通过实时荧光定量PCR (quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)方法分析了vv-exp基因在草菇不同生长阶段以及不同部位的表达量,结果显示该基因在原基表达量较高,表明此基因可能与草菇子实体的形成有关;另外,在成熟期菌盖中vv-exp表达量比原基上调达到3倍以上,且显著高于伸长期菌盖,由此推断该基因参与调控草菇子实体开伞.