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目的 本研究旨在鉴定分析椎间盘退变患者纤维环(annulus fibrosus,AF)、髓核(nucleus pulposus,NP)和全血(whole blood,WB)的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).方法 从GEO数据库中检索到包含24个AF和24个NP样本的基因表达谱的芯片数据集GSE70362,并将AF和NP样本中的DEGs与非退行性样本进行了比较.检测了椎间盘退变(In-tervertebral disc degeneration,IDD)和健康志愿者WB中的基因表达谱,以确定WB中的DEGs.采用实时荧光定量PCR(Real time quantitative PCR,QRT-PCR)验证了WB中部分DEGs的表达水平.结果 最后共鉴定出846个AF-DEGs、902个NP-DEGs和862个WB-DEGs,3组共22个相同的DEGs.蛋白二硫键异构酶A4(protein disulfide isomerase family A member 4,PDIA4)、肽基脯氨酰顺反异构酶11(FK506 BINDING PROTEIN 11,FKBP 11)、外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4,ENPP4)、超氧化物歧化酶2(superoxide dismutase 2,SOD2)和肌动蛋白结合lim蛋白1(actin binding LIM protein 1,ABLIM1)的QRT-PCR结果与基因芯片杂交结果一致.结论 本研究确定了部分潜在的椎间盘退变关键基因,可能为椎间盘退变机制研究和生物学治疗提供新的方向和依据.

作者:李胜吾;蔚浩;戴国钢

来源:颈腰痛杂志 2020 年 41卷 5期

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作者:
李胜吾;蔚浩;戴国钢
来源:
颈腰痛杂志 2020 年 41卷 5期
标签:
纤维环 髓核 全血 差异表达基因 椎间盘退变
目的 本研究旨在鉴定分析椎间盘退变患者纤维环(annulus fibrosus,AF)、髓核(nucleus pulposus,NP)和全血(whole blood,WB)的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).方法 从GEO数据库中检索到包含24个AF和24个NP样本的基因表达谱的芯片数据集GSE70362,并将AF和NP样本中的DEGs与非退行性样本进行了比较.检测了椎间盘退变(In-tervertebral disc degeneration,IDD)和健康志愿者WB中的基因表达谱,以确定WB中的DEGs.采用实时荧光定量PCR(Real time quantitative PCR,QRT-PCR)验证了WB中部分DEGs的表达水平.结果 最后共鉴定出846个AF-DEGs、902个NP-DEGs和862个WB-DEGs,3组共22个相同的DEGs.蛋白二硫键异构酶A4(protein disulfide isomerase family A member 4,PDIA4)、肽基脯氨酰顺反异构酶11(FK506 BINDING PROTEIN 11,FKBP 11)、外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4,ENPP4)、超氧化物歧化酶2(superoxide dismutase 2,SOD2)和肌动蛋白结合lim蛋白1(actin binding LIM protein 1,ABLIM1)的QRT-PCR结果与基因芯片杂交结果一致.结论 本研究确定了部分潜在的椎间盘退变关键基因,可能为椎间盘退变机制研究和生物学治疗提供新的方向和依据.