目的：探讨16S rDNA测序技术在新生儿、婴儿肠道微生态研究中的应用。方法于生后3天、1月、6月、1岁时收集2例健康婴儿粪便标本共8份，提取细菌总DNA ，以Illumina Hiseq 2000为测序平台，采用新一代高通量16S rDNA宏基因组测序技术对V6可变区测序，并进行生物信息分析（物种分类和丰度分析；多样性分析）。结果8份样品共产生原始测序数据为1027．47 Mbp ，Unique tags序列数量均值为58630，OTU数量63～209；优势菌门为Proteobacteria和Firmicutes ；在科水平，＞1％的物种1个月之内2～4种，6月后达7～10种；1号婴儿一直以Enterobacteriaceae占优势，2号婴儿优势菌群包括 Enterobacteriaceae、Lachnospiraceae、Streptococcaceae和Bacteroidaceae；4个时间点的npShannon和Simpson指数分别为1．17、1．29、2．16、2．51和0．43、0．40、0．26、0．14。结论16S rDNA测序技术能满足新生儿、婴儿肠道微生态研究需求；新生儿、婴儿粪便中含丰富细菌基因组；细菌物种丰度及分类存在个体差异；从出生到1岁，婴儿肠道菌群结构趋向复杂和多样。
作者：马丽亚；王辉林；陈睿；张敏；黄艳；卢光进
来源：检验医学与临床 2015 年 2期
