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[目的]筛选出适合分析大灰象甲Sympiezomias velatus成虫不同组织中基因表达水平的内参基因.[方法]利用转录组测序技术获得大灰象甲管家基因序列作为候选内参基因,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析候选基因在大灰象甲雌雄成虫触角、头、胸、腹和足中的表达量;并利用geNorm,NormFinder和BestKeeper软件及在线工具RefFinder评价候选基因的表达稳定性.以大灰象甲气味结合蛋白1(odorant bindng protein 1,OBP1)基因为目标基因验证候选基因在大灰象甲成虫不同组织中的表达稳定性.[结果]基于大灰象甲转录组数据首次鉴定得到β-肌动蛋白基因(ACT)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、60S核糖体蛋白L12基因(RPL 12)、60S核糖体蛋白L32基因(RPL32)、40S核糖体蛋白S20基因(RPS20)、延伸因子2基因(EF2)、α-微管蛋白基因(TUA)和β-微管蛋白基因(TUB)共9个管家基因序列.geNorm分析结果显示,RPL12和RPS20是最稳定表达的内参基因,而BestKeeper和NormFinder分析结果显示最稳定表达的内参基因分别是TUA和TUB.综合各分析方法得出9个候选基因中TUB,TUA,RPS20和RPL12是最稳定表达的内参基因,而18S rRNA,ACT和GAPDH这3个广泛应用的内参基因则表现出最低的表达稳定性.最后以OBP1为目标基因对稳

作者:李晓;李建文;成波;李伟;孙文秀;高华援;鞠倩;姜晓静;杜龙;曲春娟;曲明静

来源:昆虫学报 2018 年 61卷 11期

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李晓;李建文;成波;李伟;孙文秀;高华援;鞠倩;姜晓静;杜龙;曲春娟;曲明静
来源:
昆虫学报 2018 年 61卷 11期
标签:
大灰象甲 实时定量PCR 内参基因 基因表达分析 表达稳定性
[目的]筛选出适合分析大灰象甲Sympiezomias velatus成虫不同组织中基因表达水平的内参基因.[方法]利用转录组测序技术获得大灰象甲管家基因序列作为候选内参基因,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析候选基因在大灰象甲雌雄成虫触角、头、胸、腹和足中的表达量;并利用geNorm,NormFinder和BestKeeper软件及在线工具RefFinder评价候选基因的表达稳定性.以大灰象甲气味结合蛋白1(odorant bindng protein 1,OBP1)基因为目标基因验证候选基因在大灰象甲成虫不同组织中的表达稳定性.[结果]基于大灰象甲转录组数据首次鉴定得到β-肌动蛋白基因(ACT)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、60S核糖体蛋白L12基因(RPL 12)、60S核糖体蛋白L32基因(RPL32)、40S核糖体蛋白S20基因(RPS20)、延伸因子2基因(EF2)、α-微管蛋白基因(TUA)和β-微管蛋白基因(TUB)共9个管家基因序列.geNorm分析结果显示,RPL12和RPS20是最稳定表达的内参基因,而BestKeeper和NormFinder分析结果显示最稳定表达的内参基因分别是TUA和TUB.综合各分析方法得出9个候选基因中TUB,TUA,RPS20和RPL12是最稳定表达的内参基因,而18S rRNA,ACT和GAPDH这3个广泛应用的内参基因则表现出最低的表达稳定性.最后以OBP1为目标基因对稳