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[目的]探明褐飞虱Nilaparvata lugens成虫肠道微生物群落结构和多样性.[方法]分离褐飞虱成虫完整肠道并提取总DNA,利用Illumina MiSeq(PE300)技术对其肠道细菌16S rRNA的V3-V4变异区和真菌ITS2序列进行测序,统计肠道微生物的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析其物种组成、丰度及Alpha多样性.并通过qPCR技术验证随机挑选注释到的4种肠道菌的高通量测序数据的有效性.[结果]分别获得褐飞虱成虫肠道细菌16S rRNA和真菌ITS2优质序列32 395和24 986条,根据序列相似性进行聚类分析分别获得235和128个OTUs.其中,细菌共注释到7个门,15个纲,26个目,45个科和73个属;真菌共鉴定到3个门,9个纲,12个目,15个科和18个属.在门分类水平上,细菌以变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势门类;真菌以子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门.在属分类水平上,细菌的优势属为不动杆菌属Acinetobacter以及紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)未确定属和毛螺菌科(Lachnospiraceae)未确定属,其丰度分别为36.37%,17.22%和15.01%;真菌的优势属为粪壳菌纲(Sordariomycetes)未确定属,丰度为95.77%.Alpha多样性分析结果显示,褐飞虱肠道细菌(真菌)的观测物种数、Chaol指数、Sha

作者:王天召;王正亮;朱杭锋;王紫晔;俞晓平

来源:昆虫学报 2019 年 62卷 3期

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王天召;王正亮;朱杭锋;王紫晔;俞晓平
来源:
昆虫学报 2019 年 62卷 3期
标签:
褐飞虱 肠道微生物 16S rRNA ITS2 高通量测序 细菌 真菌 物种多样性
[目的]探明褐飞虱Nilaparvata lugens成虫肠道微生物群落结构和多样性.[方法]分离褐飞虱成虫完整肠道并提取总DNA,利用Illumina MiSeq(PE300)技术对其肠道细菌16S rRNA的V3-V4变异区和真菌ITS2序列进行测序,统计肠道微生物的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析其物种组成、丰度及Alpha多样性.并通过qPCR技术验证随机挑选注释到的4种肠道菌的高通量测序数据的有效性.[结果]分别获得褐飞虱成虫肠道细菌16S rRNA和真菌ITS2优质序列32 395和24 986条,根据序列相似性进行聚类分析分别获得235和128个OTUs.其中,细菌共注释到7个门,15个纲,26个目,45个科和73个属;真菌共鉴定到3个门,9个纲,12个目,15个科和18个属.在门分类水平上,细菌以变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势门类;真菌以子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门.在属分类水平上,细菌的优势属为不动杆菌属Acinetobacter以及紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)未确定属和毛螺菌科(Lachnospiraceae)未确定属,其丰度分别为36.37%,17.22%和15.01%;真菌的优势属为粪壳菌纲(Sordariomycetes)未确定属,丰度为95.77%.Alpha多样性分析结果显示,褐飞虱肠道细菌(真菌)的观测物种数、Chaol指数、Sha