目的:通过宏基因组方法结合高通量测序技术探究牙周炎患者口腔微生物菌群的组成和功能,及其与牙周炎发生发展的相关性.方法:分别采集10名牙周炎患者的唾液和龈下菌斑样本,并提取各样本中微生物总DNA,构建宏基因组文库,进行MGISEQ?2000测序,分别使用Metaphlan2软件、Humann2软件进行生物信息学分析.结果:微生物组成分析结果显示,在属水平上,卟啉单胞菌属在唾液及龈下样本组中的平均相对丰度无统计学差异(P>0.05);普雷沃氏菌属、噬二氧化碳细胞菌属等的相对丰度在两样本组中具有统计学差异(P<0.05).在种水平上,副流感嗜血杆菌、浅黄奈瑟球菌等在两样本组中相对丰度差异具有统计学意义(P<0.05).功能分析结果显示,唾液和龈下菌斑样本中贡献菌和序列的相对丰度具有统计学差异(P<0.05).结论:龈下微生物样本对于牙周炎致病菌方面的研究可能更具代表性,利用宏基因组学研究与牙周炎疾病相关的代谢通路值得进一步发展.
作者:许悦;张宇宸;孙斌;程政;周秦
来源:口腔生物医学 2020 年 11卷 4期