目的 构建酒精性肝炎(AH)的microRNA-mRNA差异表达网络,寻找AH新的诊疗靶标.方法 筛选AH差异表达的microRNA和mRNA;基于TargetScan、DIANA、MIRDB、PICTAR、miRWalk2.0等软件寻找差异microRNA靶基因,选取差异mRNA中与microRNA变化方向相反的靶基因,构建关键microRNA-mRNA网络;通过注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)对相关靶基因进行基因本体论(G0)分析、京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路分析;通过GCBI(www.gcbi.com.cn)在线软件对靶基因进行疾病富集分析和核心网络构建;通过Cytoscape软件中GeneMANIA数据库(genemania.org)对关键靶基因进行蛋白相互作用分析,对比3种方法通路分析寻找AH发生过程中的关键通路.结果 构建以hsa-mir-21-5p、hsa-mir-148a-3p和hsa-mir-30e-5p等5个差异microRNA及Ⅳ胶原α1链(COL4A1)、血栓反应素2(THBS2)和整合素亚单位α6(ITGA6)等51个靶基因为主体的AH关键microRNA-mRNA网络;构建关键靶基因相关的蛋白相互作用网络;GO分析和各种通路分析分析显示,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)通路和局部黏附等过程与AH密切相关.结论 AH发病过程中,多种关键靶基因相关蛋白存在复杂的相互作用,COL4A1和THBS2可能通过激活ITGA6调节PI3K-Akt通路和局部黏附等过程,促进AH的发
作者:张秀芝;李宁宁;刘晓丽;亢春彦;张进忠
来源:临床肝胆病杂志 2019 年 35卷 3期