目的 阐明内质网应激基因在胰腺癌预后中的作用,寻找胰腺癌的预后标志物并构建预后预测模型.方法 从TCGA和GTEx数据库下载转录组测序数据,通过MsigDB网站获取内质网应激基因,通过单因素Cox回归分析,获取预后相关基因,利用共识聚类分析方法构建胰腺癌分子分型,获取两亚群间的差异表达基因,通过Lasso回归分析,获得胰腺癌预后相关的核心基因,用于构建胰腺癌的预后预测模型,通过GEO数据库获取数据集对模型的预测性能进行验证.利用CIBERSORT分析风险评分与免疫浸润的相关性.实时荧光定量PCR检测基因在胰腺癌组织和细胞系中的表达情况.计量资料两组间比较采用成组t检验.计数资料两组间比较采用χ2检验.利用Log-rank检验进行生存期的比较.通过评估ROC曲线下的面积以评价模型的预测价值.结果 内质网应激基因CEBPB、MARCKS、PMAIP1、UBXN10是胰腺癌预后的独立危险因素,基于它们的表达特征能够将TCGA胰腺癌队列分为两个亚群,簇A和簇B,簇A患者的总体生存期比簇B更短(χ2=12.232,P=0.01).利用Lasso回归从簇A和簇B间差异表达的影响胰腺癌预后的基因中筛选出5个核心基因,获得的风险评分为:0.156×CDA+0.135×AHNAK2+0.020×RHOV+0.095×LY6D+0.054×SPRR1B,ROC曲线反映该模型的总体预测性能良好,1、3、5年的ROC曲线下面
作者：吕胜男；彭新宇；张健；刘欢；魏锋
来源：临床肝胆病杂志 2023 年 39卷 12期
