目的 通过TCGA数据库中肝癌高通量测序数据的分析,寻找新的肝癌预后相关的miRNA,为后续研究提供数据支持.方法 下载TCGA数据库中miRNA表达数据及肝癌患者相关临床病理参数,基于R语言进行数据的整理、合并及标准化;分别采用单因素Cox生存分析模型及BhGLM R软件包中指数先验分布模型对miRNA表达数据进行分析,并选择两种方法筛选结果的交集.结果 单因素Cox生存分析模型共筛选出63个预后相关miRNA(P<0.05),指数先验分布模型筛选出77个miRNA,两种方法共筛选出包括miR-188、miR-576、miR-887及miR-91等18个与肝癌患者预后密切相关的miRNA.结论 单因素Cox模型联合指数先验分布模型筛选出的肝癌预后相关miRNA具有较高的可信度,或可成为肝癌预后判断的新指标.
作者:石旦;徐斌;蒋敬庭
来源:临床检验杂志 2017 年 35卷 11期