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目的 探讨储存红细胞中circRNA对泛素蛋白水解通路调节的可能机制及其在红细胞储存损伤中可能发挥的作用的预测分析.方法 健康无偿献血者3(人)份血液制备的悬浮红细胞,过滤白细胞后平均分为新鲜组(0 d组),4℃储存20 d红细胞组(20 d组),4℃储存40 d红细胞组(40 d组);对3组标本用高通量测序检测,然后做KEGG和GO分析,选取母基因在泛素介导的蛋白水解通路中的circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析.用circRNA interactome预测circRNA的RBP结合蛋白.结果 与泛素蛋白水解调控相关的hsa_circ_0036044、hsa_circ_0024173、hsa-miR-4530表达量,20 d组均高于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05),20 d组的hsa_circ_0035761和TRAF2表达量低于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05);40 d组hsa_circ_0002502表达量低于0 d组,且差异有统计学意义(P<0.05);40 d组的hsa_circ_0024173和hsa-miR-4530表达量低于与20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05),40 d组的hsa_circ_0028196、hsa_circ_0035761、TRAF2表达量高于20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05).进一步通过生物信息学分析预测显示hsa_circ_0035761参与抗凋亡生理过程.结论 本研究发现了多个体外储存红细胞中与

作者:张怡宇;黄国清;张勇刚;苑召虎;王强;陈小洁;黄建云;李楠;魏亚明

来源:临床输血与检验 2021 年 23卷 4期

知识库介绍

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作者:
张怡宇;黄国清;张勇刚;苑召虎;王强;陈小洁;黄建云;李楠;魏亚明
来源:
临床输血与检验 2021 年 23卷 4期
标签:
红细胞储存损伤 环状RNA分子 小RNA分子 RNA结合蛋白 凋亡
目的 探讨储存红细胞中circRNA对泛素蛋白水解通路调节的可能机制及其在红细胞储存损伤中可能发挥的作用的预测分析.方法 健康无偿献血者3(人)份血液制备的悬浮红细胞,过滤白细胞后平均分为新鲜组(0 d组),4℃储存20 d红细胞组(20 d组),4℃储存40 d红细胞组(40 d组);对3组标本用高通量测序检测,然后做KEGG和GO分析,选取母基因在泛素介导的蛋白水解通路中的circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析.用circRNA interactome预测circRNA的RBP结合蛋白.结果 与泛素蛋白水解调控相关的hsa_circ_0036044、hsa_circ_0024173、hsa-miR-4530表达量,20 d组均高于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05),20 d组的hsa_circ_0035761和TRAF2表达量低于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05);40 d组hsa_circ_0002502表达量低于0 d组,且差异有统计学意义(P<0.05);40 d组的hsa_circ_0024173和hsa-miR-4530表达量低于与20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05),40 d组的hsa_circ_0028196、hsa_circ_0035761、TRAF2表达量高于20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05).进一步通过生物信息学分析预测显示hsa_circ_0035761参与抗凋亡生理过程.结论 本研究发现了多个体外储存红细胞中与