[背景]磷酸三苯酯(TPHP)是目前应用最广泛的有机磷酸酯类阻燃剂之一,已在多种环境介质中被检测到.由于该化合物的多重毒性,近年来TPHP的健康风险引起了广泛的关注.然而,有关TPHP暴露对肝脏代谢影响的研究较少.[目的]基于转录组测序数据,采用生物信息学方法探讨TPHP暴露对大鼠肝脏代谢紊乱的效应.[方法]基于基因表达数据库(GEO)获得基因表达谱数据集.采用主成分分析和层次聚类分析方法,依据不同剂量组的基因表达模式的相似程度将样本归类至对照组(0 mg·kg-1,含5个样本)、低剂量组(55.0、110.0、220.0 mg·kg-1,含9个样本)和高剂量组(441.0、881.0 mg·kg-1,含6个样本);利用R3.5.3软件中limma包筛选差异表达基因(DEGs).运用clusterProfiler包对DEGs进行基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析.利用STRING网络数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并运用Cytoscape 3.7.1软件的网络分析插件CytoHubba筛选中心基因.最后,运用clusterProfiler包对重要的中心基因进行基因集富集分析(GSEA).[结果]与对照组相比,低剂量组DEGs共53个,其中表达上调的基因30个,表达下调的基因23个;而高剂量组DEGs共151个,其中表达上调的基因80个,表达下调的基因71个.GO和KEGG富集分析显示,两个剂量组与对照组的DE
作者：胡维；王姝；于海兵；丁元林
来源：环境与职业医学 2020 年 37卷 2期
