目的:应用生物信息学探索非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)发病机制,筛选目标基因.方法:使用R语言limma包对基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中NSCLC数据集进行差异表达基因鉴定,并对差异表达基因进行基因本体论(gene ontology,GO)分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,然后通过STRING数据库和Cytoscape进行关键基因筛选,在Kaplan-Meier Plotter数据库对核心基因进行生存曲线分析,并对感兴趣的核心基因进行表达差异的验证,使用TargetScan数据库预测调控靶基因的微小RNA(microRNA,miRNA).结果:共筛选出289个差异表达基因,蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选出10个核心基因,其中ladinin-1(LAD1)在蛋白印迹分析中表达差异明显,Kaplan-Meier Plotter数据库显示LAD1在肺腺癌组织中高表达与不良预后有关.TargetScan数据库预测调控靶基因的miR-124-3p与LAD1的mRNA的3'UTR结合.miR-124-3p在NSCLC组织中表达明显下调,且与女性肺腺癌患者的预后具有一定相关性.结论:miR-124-3p调控的LAD1可能是女性肺腺癌潜在的治疗靶点.
作者：孙百尔；钱佳燕
来源：南通大学学报（医学版） 2023 年 43卷 5期
