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目的 缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)发病率高、死亡率高.本实验利用单细胞转录组测序技术探索IS脑细胞的基因表达差异情况,尝试为IS的治疗提供一个新的思路.方法 分别选取去骨瓣减压术切除大面积脑梗死患者和颅脑创伤患者的脑组织各2g作为实验组和对照组,进行单细胞转录组测序,对测序结果进行差异表达基因的GO注释和KEGG通路分析.结果 ①本实验共检测出有效细胞实验组1635个,对照组627个,上述细胞依据表达情况可以分出7个细胞群;②在两组之间鉴定到30个具有表达差异的转录本.实验组与对照组比较,表达上调的差异转录本有13个,表达下调的差异转录本有17个;③共有23个基因注释到GO系统的84个功能类别(P<0.05),注释到细胞组成的基因有15个;注释到生物过程的基因有10个;注释到分子功能大类的基因有8个.KEGG通路分析结果显示这些差异表达基因中有4个富集到核糖体的形成通路.结论 ①用单细胞转录组测序技术对IS脑细胞进行基因表达分析是可行的;②IS患者的脑细胞基因表达对比颅脑创伤患者存在差异.

作者:韦婉;李国忠

来源:脑与神经疾病杂志 2020 年 28卷 10期

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作者:
韦婉;李国忠
来源:
脑与神经疾病杂志 2020 年 28卷 10期
标签:
缺血性脑卒中 单细胞转录组测序 差异表达基因
目的 缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)发病率高、死亡率高.本实验利用单细胞转录组测序技术探索IS脑细胞的基因表达差异情况,尝试为IS的治疗提供一个新的思路.方法 分别选取去骨瓣减压术切除大面积脑梗死患者和颅脑创伤患者的脑组织各2g作为实验组和对照组,进行单细胞转录组测序,对测序结果进行差异表达基因的GO注释和KEGG通路分析.结果 ①本实验共检测出有效细胞实验组1635个,对照组627个,上述细胞依据表达情况可以分出7个细胞群;②在两组之间鉴定到30个具有表达差异的转录本.实验组与对照组比较,表达上调的差异转录本有13个,表达下调的差异转录本有17个;③共有23个基因注释到GO系统的84个功能类别(P<0.05),注释到细胞组成的基因有15个;注释到生物过程的基因有10个;注释到分子功能大类的基因有8个.KEGG通路分析结果显示这些差异表达基因中有4个富集到核糖体的形成通路.结论 ①用单细胞转录组测序技术对IS脑细胞进行基因表达分析是可行的;②IS患者的脑细胞基因表达对比颅脑创伤患者存在差异.