目的 胃癌的分子发病机制与预后仍是亟待解决的难题.本研究通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库筛选出在胃癌中表达失调的基因,构建长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(mRNA)调节网络,寻找并分析网络中与胃癌患者预后相关的关键调控基因,为胃癌提供新型分子标志物.方法 从TCGA官方网站中下载胃癌RNA测序数据和临床数据,使用R软件edgeR包分析胃癌中差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA,构建差异lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.使用R软件中的survival包对调控网络中的基因进行分析,寻找与胃癌预后相关的关键基因.使用Kaplan Meier-plotter在线数据库分析这些关键基因的预后作用.结果 共有62个lncRNA、10个miRNA和10个mRNA分子参与调控网络的构建.Kaplan Meier生存分析显示,2个mRNA(ATAD2、SERPINE1),10个lncRNA(AC018781.1、ADAMTS9-AS1、ADAMTS9-AS2、AL139002.1、AL391152.1、C150rf54、IGF2 AS、LINC00326、NKX2 1 AS1、POU6F2 AS2)和2个miRNA(miR 145、miR-508)与胃癌患者预后有统计学意义的关联,P＜0.05.Kaplan Meier-plotter数据库分析显示,mRNA ATAD2(HR=1.66,95％CI为1.32～2.08,P＜0.001)和SERPINE1(HR=1.36,95％CI为1.13～1.64,P=0.001)与胃

作者：胡珊；黄奔；姜扬；黄亚慧；徐静侠；顾锋

来源：中华肿瘤防治杂志 2020 年 27卷 7期