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目的 构建高血压脑出血患者脑组织差异表达miRNA,并进行生物信息学分析.方法 选取行高血压脑出血手术患者脑血肿腔壁脑组织标本16 例,同期选择重型颅脑损伤且具有高血压病史患者脑组织标本 16 例作为对照组.通过Trizol法提取标本总RNA,筛选出差异表达的miRNA.利用生物信息学技术分析差异表达miRNA的特点,通过String数据库得到靶基因蛋白互作分析结果,Cytoscape软件进行miRNA-mRNA核心调控网络可视化.结果 实验组与对照组相比较共筛选出差异表达miRNA 43 个(P<0.05),其中上调miRNA共 7 个,下调miRNA共 36 个.对差异miRNA的靶基因进行KEGG/GO富集分析,得到与高血压脑出血相关的信号通路:cAMP 信号通路、ErbB 信号通路、Calcium信号通路、Wnt 信号通路(P<0.05).构建miRNA-mRNA可视化网络图,发现关联度最高的 miRNA 为:hsa-miR-1303、hsa-miR-1972、hsa-miR-362-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-378d,PPI 蛋白互作分析发现连接度最高的前三个基因为:MAPK1、GRB2 和RAC1.结论 差异miRNA可能在自发性高血压脑出血的发病机制中具有重要作用,可能为自发性高血压脑出血的治疗及预防提供潜在治疗靶点及方向.

作者:胥成朗;肖文峰;刘峻伶;李强;陈礼刚;蒋正方

来源:四川医学 2023 年 44卷 9期

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作者:
胥成朗;肖文峰;刘峻伶;李强;陈礼刚;蒋正方
来源:
四川医学 2023 年 44卷 9期
标签:
miRNA 高血压脑出血 脑组织 调控网络 microRNA hypertensive cerebral hemorrhage brain tissue regulatory network
目的 构建高血压脑出血患者脑组织差异表达miRNA,并进行生物信息学分析.方法 选取行高血压脑出血手术患者脑血肿腔壁脑组织标本16 例,同期选择重型颅脑损伤且具有高血压病史患者脑组织标本 16 例作为对照组.通过Trizol法提取标本总RNA,筛选出差异表达的miRNA.利用生物信息学技术分析差异表达miRNA的特点,通过String数据库得到靶基因蛋白互作分析结果,Cytoscape软件进行miRNA-mRNA核心调控网络可视化.结果 实验组与对照组相比较共筛选出差异表达miRNA 43 个(P<0.05),其中上调miRNA共 7 个,下调miRNA共 36 个.对差异miRNA的靶基因进行KEGG/GO富集分析,得到与高血压脑出血相关的信号通路:cAMP 信号通路、ErbB 信号通路、Calcium信号通路、Wnt 信号通路(P<0.05).构建miRNA-mRNA可视化网络图,发现关联度最高的 miRNA 为:hsa-miR-1303、hsa-miR-1972、hsa-miR-362-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-378d,PPI 蛋白互作分析发现连接度最高的前三个基因为:MAPK1、GRB2 和RAC1.结论 差异miRNA可能在自发性高血压脑出血的发病机制中具有重要作用,可能为自发性高血压脑出血的治疗及预防提供潜在治疗靶点及方向.