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目的 利用RNA-seq技术研究谷氨酰胺剥夺对喉癌细胞基因表达谱的影响.方法 CCK8检测喉癌细胞增殖速度,RNA sequence检测转录组学的改变.结果 谷氨酰胺剥夺限制喉癌细胞的增殖,转录组分析发现谷氨酰胺剥夺导致328个基因上调,210个基因下调;GO分析发现上述基因与细胞代谢、蛋白质和核苷酸的合成相关;KEGG信号通路分析发现上述基因与O-多聚糖、糖基磷脂酰肌醇的生物合成,果糖、甘露糖、氨基酸和核苷酸的代谢,P53信号通路相关;疾病富集发现差异表达的基因主要与头颈部肿瘤相关.结论 谷氨酰胺剥夺限制核酸代谢、RNA和蛋白质的结合,影响P53信号通路.

作者:王晓亭;陈正侬;易红良

来源:山东大学耳鼻喉眼学报 2022 年 36卷 2期

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作者:
王晓亭;陈正侬;易红良
来源:
山东大学耳鼻喉眼学报 2022 年 36卷 2期
标签:
喉癌 谷氨酰胺代谢 RNA测序
目的 利用RNA-seq技术研究谷氨酰胺剥夺对喉癌细胞基因表达谱的影响.方法 CCK8检测喉癌细胞增殖速度,RNA sequence检测转录组学的改变.结果 谷氨酰胺剥夺限制喉癌细胞的增殖,转录组分析发现谷氨酰胺剥夺导致328个基因上调,210个基因下调;GO分析发现上述基因与细胞代谢、蛋白质和核苷酸的合成相关;KEGG信号通路分析发现上述基因与O-多聚糖、糖基磷脂酰肌醇的生物合成,果糖、甘露糖、氨基酸和核苷酸的代谢,P53信号通路相关;疾病富集发现差异表达的基因主要与头颈部肿瘤相关.结论 谷氨酰胺剥夺限制核酸代谢、RNA和蛋白质的结合,影响P53信号通路.