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目的 分析2013年贵州省流行的麻疹病毒核蛋白基因特征.方法 采集疑似麻疹病例临床标本(咽拭子、尿液和血清),从临床标本或Vero/SLAM细胞分离出的阳性培养物中提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白基因羧基末端编码的634个核苷酸片段,并进行序列测定与基因特征分析.结果 74例疑似麻疹病例中检测到41株麻疹核酸.基因亲缘关系显示39株为H1基因型中的H1a基因亚型并且有2个明显分支;2株为麻疹疫苗株(A基因型).39株麻疹病毒株与H1基因型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7(AF045212)的核苷酸和氨基酸差异分别为2.0% ~2.9%和2.0%~4.7%:与H1a基因亚型参考株Chin9322的核苷酸和氨基酸差异分别为0.9% ~1.8%和0.7% ~3.4%;39株H1a基因亚型的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.3% ~ 100%和96.6%~ 100%.2株麻疹疫苗株与MV沪191(S191)的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%~100%和99.3%~100%.结论 H1a基因亚型是贵州省2013年本土麻疹流行的优势基因型,同一年份存在着不同的传播链.

作者:唐小敏;张丽;叶绪芳;任刚;左丽

来源:山东大学学报(医学版) 2017 年 55卷 3期

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作者:
唐小敏;张丽;叶绪芳;任刚;左丽
来源:
山东大学学报(医学版) 2017 年 55卷 3期
标签:
麻疹病毒 核蛋白 基因型 序列分析 Measles virus Nucleoprotein Genotype Sequence analysis
目的 分析2013年贵州省流行的麻疹病毒核蛋白基因特征.方法 采集疑似麻疹病例临床标本(咽拭子、尿液和血清),从临床标本或Vero/SLAM细胞分离出的阳性培养物中提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白基因羧基末端编码的634个核苷酸片段,并进行序列测定与基因特征分析.结果 74例疑似麻疹病例中检测到41株麻疹核酸.基因亲缘关系显示39株为H1基因型中的H1a基因亚型并且有2个明显分支;2株为麻疹疫苗株(A基因型).39株麻疹病毒株与H1基因型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7(AF045212)的核苷酸和氨基酸差异分别为2.0% ~2.9%和2.0%~4.7%:与H1a基因亚型参考株Chin9322的核苷酸和氨基酸差异分别为0.9% ~1.8%和0.7% ~3.4%;39株H1a基因亚型的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.3% ~ 100%和96.6%~ 100%.2株麻疹疫苗株与MV沪191(S191)的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%~100%和99.3%~100%.结论 H1a基因亚型是贵州省2013年本土麻疹流行的优势基因型,同一年份存在着不同的传播链.