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目的 研制一种用于检测口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的基因芯片.方法 选择口腔感染中常见的无芽胞厌氧性细菌作为菌种,将16S rDNA作为靶基因.借助生物信息学方法,设计通用引物和特异性探针,选择与反义引物互补的核酸序列作为阳性质控探针;大肠杆菌16S rDNA基因序列为阴性质控探针,制备微阵列.进行厌氧性细菌DNA的提取、扩增、杂交、结果分析以及微阵列质量检测.结果 制备的用于检测口腔常见无芽胞厌氧菌感染的基因芯片特异性、灵敏度、重现性和稳定性均符合实验要求.结论 利用生物信息学方法设计的引物和探针合理,制备的芯片可用于口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的诊断.

作者:张远;宋长芹;韩金祥;黄海南;李光武;于秀娟;汪晓静;宋立清

来源:山东医药 2011 年 51卷 15期

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作者:
张远;宋长芹;韩金祥;黄海南;李光武;于秀娟;汪晓静;宋立清
来源:
山东医药 2011 年 51卷 15期
标签:
细菌,厌氧 感染,口腔 微阵列 脱氧核糖核酸,核糖体
目的 研制一种用于检测口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的基因芯片.方法 选择口腔感染中常见的无芽胞厌氧性细菌作为菌种,将16S rDNA作为靶基因.借助生物信息学方法,设计通用引物和特异性探针,选择与反义引物互补的核酸序列作为阳性质控探针;大肠杆菌16S rDNA基因序列为阴性质控探针,制备微阵列.进行厌氧性细菌DNA的提取、扩增、杂交、结果分析以及微阵列质量检测.结果 制备的用于检测口腔常见无芽胞厌氧菌感染的基因芯片特异性、灵敏度、重现性和稳定性均符合实验要求.结论 利用生物信息学方法设计的引物和探针合理,制备的芯片可用于口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的诊断.