目的:用生物信息学方法研究2型糖尿病与胰腺癌之间的关系。方法在基因表达汇编数据库中分别下载2型糖尿病的基因表达谱及其对照,以及胰腺癌的基因表达谱及其对照。使用R语言中的Limma方法筛选差异基因;用在线服务器DAVID富集通路;将最终结果进行比较。结果2型糖尿病筛选出上调基因416个,下调基因348个(P均<0.05);胰腺癌筛选出上调基因778个,下调基因129个(P均<0.05)。2型糖尿病上调的差异基因所富集到的通路与胰腺癌上调的差异基因所富集到的通路相同的有3条,分别为癌症通路、轴突导向通路和小细胞肺癌通路,共有一个基因ENTREZ_GENE_ID:3845。在轴突导向通路中,共有Nras ( ENTREZ_GENE_ID:4893)和Kras(ENTREZ_GENE_ID:3845)基因。下调的基因所富集到的通路相同的有ECM-受体相互作用和局部粘连。结论在生物学角度上证明了2型糖尿病患者更容易患胰腺癌。
作者:孙丽岩;李珺;王泳
来源:山东医药 2014 年 9期