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目的 通过网络药理学和分子对接探讨灯盏花乙素治疗高脂血症的潜在分子生物学机制.方法 通过Pharmmapper平台寻找灯盏花乙素药效团作用靶点基因,通过Genecard和OMIM数据库筛选高脂血症相关靶点基因,构建化合物-靶点基因-疾病网络,获取共同作用靶点基因.将共同作用靶点基因上传至String平台,建立蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点基因.利用DAVID数据库对核心靶点蛋白进行GO生物过程及KEGG通路富集分析.通过AutoDock Vina软件对灯盏花乙素与核心靶点蛋白进行分子对接验证.结果 灯盏花乙素潜在作用靶点基因366个,高脂血症相关靶点基因1280个,筛选出共有靶点基因39个,PPI网络中degree前6位的靶点基因有过氧化氢酶(CAT)、血红素加氧酶1(HMOX1)、髓过氧化物酶(MPO)、前列腺素-内过氧化物合酶2(PTGS2)、血管紧张素Ⅰ转换酶(ACE)、C反应蛋白(CRP),为核心靶点基因.主要参与的生物过程包括氧化应激反应、氧气水平的反应、抗生素反应、缺氧的反应、营养水平的反应、细胞排毒反应等;涉及的信号通路主要有PPAR信号通路、脂肪的消化吸收、花生四烯酸代谢、TNF信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胆固醇代谢、调节脂肪细胞中的脂肪分解等.灯盏花乙素与CAT、MPO、PTGS2、ACE、HMXO1、CRP的活性位点均能够形成2个以

作者:刘思莹;任蓁;凌爽;牛文颖;王雨晴;郭婉琴;肖洪彬

来源:山东医药 2020 年 60卷 32期

知识库介绍

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作者:
刘思莹;任蓁;凌爽;牛文颖;王雨晴;郭婉琴;肖洪彬
来源:
山东医药 2020 年 60卷 32期
标签:
灯盏花乙素 高脂血症 生物信息学分析 网络药理学 分子对接
目的 通过网络药理学和分子对接探讨灯盏花乙素治疗高脂血症的潜在分子生物学机制.方法 通过Pharmmapper平台寻找灯盏花乙素药效团作用靶点基因,通过Genecard和OMIM数据库筛选高脂血症相关靶点基因,构建化合物-靶点基因-疾病网络,获取共同作用靶点基因.将共同作用靶点基因上传至String平台,建立蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点基因.利用DAVID数据库对核心靶点蛋白进行GO生物过程及KEGG通路富集分析.通过AutoDock Vina软件对灯盏花乙素与核心靶点蛋白进行分子对接验证.结果 灯盏花乙素潜在作用靶点基因366个,高脂血症相关靶点基因1280个,筛选出共有靶点基因39个,PPI网络中degree前6位的靶点基因有过氧化氢酶(CAT)、血红素加氧酶1(HMOX1)、髓过氧化物酶(MPO)、前列腺素-内过氧化物合酶2(PTGS2)、血管紧张素Ⅰ转换酶(ACE)、C反应蛋白(CRP),为核心靶点基因.主要参与的生物过程包括氧化应激反应、氧气水平的反应、抗生素反应、缺氧的反应、营养水平的反应、细胞排毒反应等;涉及的信号通路主要有PPAR信号通路、脂肪的消化吸收、花生四烯酸代谢、TNF信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胆固醇代谢、调节脂肪细胞中的脂肪分解等.灯盏花乙素与CAT、MPO、PTGS2、ACE、HMXO1、CRP的活性位点均能够形成2个以