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目的 筛选自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点,并分析其生物学功能.方法 首先在TCMSP、TCMID及化学专业数据库中收集自拟出血性中风1号方化学成分及作用靶点,利用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取与脑出血相关的靶点.利用R软件将自拟出血性中风1号方作用靶点与脑出血相关靶点取交集获取共同靶点(潜在作用靶点);将所得到的共同靶点通过String平台进行蛋白质互相作用(PPI)筛选出自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点.利用metascape数据库及R软件对自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点进行生物学功能分析(GO及KEGG富集分析).最后利用Pymol、AutoDock Vina将自拟出血性中风1号方核心化学成分与关键靶点进行分子对接验证.结果 共收集到自拟出血性中风1号方53种有效中药化学成分,124个药物作用靶点,1896个脑出血相关靶点,最终得到自拟出血性中风1号方治疗脑出血的潜在作用靶点71个.PPI筛选出的关键靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等.GO共富集到1715个条目,主要涉及到氧化应激、细胞凋亡等方面;KEGG通路富集到130个条目,主要包括PI3K-AKT信号通路、P53信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路等.分子对接结果显示中风1号方核心化学成分与关键靶点结合能力较强.结论 中风1号方治疗脑出血的作用

作者:吴倩;王晓玲;唐勇;张洁

来源:山东医药 2021 年 61卷 3期

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吴倩;王晓玲;唐勇;张洁
来源:
山东医药 2021 年 61卷 3期
标签:
中药 出血性中风1号方 脑出血 出血性中风1号方作用靶点
目的 筛选自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点,并分析其生物学功能.方法 首先在TCMSP、TCMID及化学专业数据库中收集自拟出血性中风1号方化学成分及作用靶点,利用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取与脑出血相关的靶点.利用R软件将自拟出血性中风1号方作用靶点与脑出血相关靶点取交集获取共同靶点(潜在作用靶点);将所得到的共同靶点通过String平台进行蛋白质互相作用(PPI)筛选出自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点.利用metascape数据库及R软件对自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点进行生物学功能分析(GO及KEGG富集分析).最后利用Pymol、AutoDock Vina将自拟出血性中风1号方核心化学成分与关键靶点进行分子对接验证.结果 共收集到自拟出血性中风1号方53种有效中药化学成分,124个药物作用靶点,1896个脑出血相关靶点,最终得到自拟出血性中风1号方治疗脑出血的潜在作用靶点71个.PPI筛选出的关键靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等.GO共富集到1715个条目,主要涉及到氧化应激、细胞凋亡等方面;KEGG通路富集到130个条目,主要包括PI3K-AKT信号通路、P53信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路等.分子对接结果显示中风1号方核心化学成分与关键靶点结合能力较强.结论 中风1号方治疗脑出血的作用