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目的 预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位.方法 以UniProt蛋白质数据库中检索Ct MOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及Net CTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位.应用Galaxy WEB对MOMP进行三维结构建模分析.结果 MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42~52 aa、161~179 aa、259~265 aa和349~358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多.结论 沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42~65 aa、155~185 aa区段和C端342~359 aa区段.

作者:李明洋;徐远久;鲁小龙;张雷;苏惠婷;朱珊丽;张友秀

来源:山东医药 2022 年 62卷 20期

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作者:
李明洋;徐远久;鲁小龙;张雷;苏惠婷;朱珊丽;张友秀
来源:
山东医药 2022 年 62卷 20期
标签:
沙眼衣原体 主要外膜蛋白 抗原表位 生物信息学
目的 预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位.方法 以UniProt蛋白质数据库中检索Ct MOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及Net CTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位.应用Galaxy WEB对MOMP进行三维结构建模分析.结果 MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42~52 aa、161~179 aa、259~265 aa和349~358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多.结论 沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42~65 aa、155~185 aa区段和C端342~359 aa区段.