目的 筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考.方法 在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因(DEGs);通过WGCNA包筛选出银屑病相关性最高的基因模块;将获取的银屑病DEG s与银屑病相关性最高的模块取交集,获得银屑病高度相关DEG s,并对其进行GO分析、KEGG分析.采用MCC、DEGREE、EPC和 CLOSENESS算法从银屑病高度相关DEG s中筛选出与银屑病相关性更强的DEGs为银屑病发病关键基因.利用 CIBERSORT 反卷积法、Pearson相关分析银屑病发病关键基因与免疫浸润细胞比例的关系.通过将银屑病发病关键基因映射至 COREMINE medical数据库,筛选出对银屑病有治疗潜力的中药.结果 共筛选出 348 个DEG s.GO 富集分析显示DEGs主要富集在对外部生物刺激的反应、线粒体蛋白复合体、内肽酶活性、丝氨酸型肽酶活性等方面;KEGG 富集分析显示其主要涉及NF-κ B信号通路、Toll样受体信号通路、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、P53信号通路、IL-17信号通路等与银屑病发病相关的信号通路.最终得到了PCNA、CXCL8、S100A9、CCNB1四个银屑病发病关键基因.银屑病发病关键基因PCNA和CCNB1与中性粒细胞
作者:潘素跃;王朴;黄巧;胡敏;彭怡;李伟佳;戚嘉慧;刘凌宇;江千帆;何玉清
来源:山东医药 2023 年 63卷 27期