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目的·分析线粒体核糖体蛋白L12 (mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能.方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER和GEPIA (gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中MRPL12在不同癌组织中的表达情况的影响.利用Sangerbox生物信息分析平台对MRPL12差异表达的癌症类型进行Cox回归和Kaplan-Meier生存分析,评估风险比(hazard ratio,HR)、95%置信区间(confidence interval,CI)和Log-rank P值.采用UALCAN数据分析平台评估MRPL12蛋白表达与临床病理参数的关系.使用LinkedOmics数据库筛选与MRPL12表达相关的基因.采用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.定量聚合酶链反应验证MRPL12在细胞中的转录水平.结果·MRPL12在多种癌组织中显著高表达,但只有在LUAD中MRPL12的高表达与患者较差的总体生存期(overall suivival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;肿瘤分级程度越高的LUAD患者MRPL12蛋白表达水平越高;在LUAD基因表

作者:熊雷;易茜;许明芳;陈健

来源:上海交通大学学报(医学版) 2021 年 41卷 8期

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熊雷;易茜;许明芳;陈健
来源:
上海交通大学学报(医学版) 2021 年 41卷 8期
标签:
肺腺癌 线粒体核糖体蛋白L12 生存分析 预后 生物标志物 治疗靶点
目的·分析线粒体核糖体蛋白L12 (mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能.方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER和GEPIA (gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中MRPL12在不同癌组织中的表达情况的影响.利用Sangerbox生物信息分析平台对MRPL12差异表达的癌症类型进行Cox回归和Kaplan-Meier生存分析,评估风险比(hazard ratio,HR)、95%置信区间(confidence interval,CI)和Log-rank P值.采用UALCAN数据分析平台评估MRPL12蛋白表达与临床病理参数的关系.使用LinkedOmics数据库筛选与MRPL12表达相关的基因.采用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.定量聚合酶链反应验证MRPL12在细胞中的转录水平.结果·MRPL12在多种癌组织中显著高表达,但只有在LUAD中MRPL12的高表达与患者较差的总体生存期(overall suivival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;肿瘤分级程度越高的LUAD患者MRPL12蛋白表达水平越高;在LUAD基因表